User:Alexander S Mikheyev/Notebook/rotifer alien genes/2010/04/22

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
Alien genes Main project page
Previous entry      Next entry

Nuclear Gene HS Takara PCR Optimization

Mix A : HS Takara RXN Mixture conc 1X 6.5 '
Milli Q water 2.1 13.65
Takara HS Buffer 10X 2 13
dNTP 2.5uM 0.8 5.2
Primer Mix 20uM 4
HS Taq 5U 0.1 0.65
Template 1ng / 20ng 1 6.5
39 8.0ul / RXN
Mix B : HS Takara RXN Mixture conc 1X 6.5
Milli Q water 5.1 33.15
Takara HS Buffer 10X 2 13
dNTP 2.5uM 0.8 5.2
Primer Mix 5uM 1
HS Taq 5U 0.1 0.65
Template 1ng 1 6.5
58.5 7.0ul / RXN
A PCR cycle
95C 3 min
95C 5 sec
60C 1 min
x35


Sample 1-18 on Machine 1 / Sample 19-36 on Machine 2

AMP Lane Template Mix A : New 20uM Primer AMP Lane Template Mix A :New 20uM Primer
1 AV 1ng A1 19 AV 1ng A1
2 AV 1ng A2 20 AV 1ng A2
3 AV 1ng A3 21 AV 1ng A3
4 AV 1ng A4 22 AV 1ng A4
5 AV 1ng A5 23 AV 1ng A5
6 AV 1ng A6 24 AV 1ng A6
7 AV 20ng A1 25 AV 20ng A1
8 AV 20ng A2 26 AV 20ng A2
9 AV 20ng A3 27 AV 20ng A3
10 AV 20ng A4 28 AV 20ng A4
11 AV 20ng A5 29 AV 20ng A5
12 AV 20ng A6 30 AV 20ng A6
Mix B : Old 5uM Primer Mix B : Old 5uM Primer
13 AV 1ng A1 31 AV 1ng A1
14 AV 1ng A2 32 AV 1ng A2
15 AV 1ng A3 33 AV 1ng A3
16 AV 1ng A4 34 AV 1ng A4
17 AV 1ng A5 35 AV 1ng A5
18 AV 1ng A6 36 AV 1ng A6

Load 2.0ul Sample

HS Takara RXN Mixture conc 1X 6.5 '
Milli Q water 3.1 20.15
Takara HS Buffer 10X 2 13
dNTP 2.5uM 0.8 5.2
Primer Mix 20uM 2
HS Taq 5U 0.1 0.65
Template Instagene / 1ng 2 13
52 8.0ul / RXN
A PCR cycle
95C 3 min
95C 5 sec
60C 1 min
x35
AMP Lane Template 2.0ul Primer
1 71 Instagene A1
2 71 Instagene A2
3 71 Instagene A3
4 71 Instagene A4
5 71 Instagene A5
6 71 Instagene A6
7 72 Instagene A1
8 72 Instagene A2
9 72 Instagene A3
10 72 Instagene A4
11 72 Instagene A5
12 72 Instagene A6
13 AV 1ng A1
14 AV 1ng A2
15 AV 1ng A3
16 AV 1ng A4
17 AV 1ng A5
18 AV 1ng A6

Load 2.0ul Sample