Yanglab

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search

Home           Members           Publications           Research           Notebook


实验室介绍

    实验室PI是杨跃东博士,担任数据科学与计算机学院教授、超算中心副总工程师、学院智能健康医疗中心副主任,是国家青年海外高层次引进人才、广东省“珠江人才” 创新团队第二核心成员。毕业于中国科学技术大学,先后于2000年和2006年获得学士和博士学位,此后分别于美国印地安那大学(2006-2013)和澳大利亚格里菲斯大学(2013-2017)进行多年结构生物信息学研究,已发表70多篇SCI研究论文,近五年引用2000多次,h-index=26,5篇第一或通讯作者论文单篇引用过百,两篇入选ESI高引论文。已开发十几项预测程序包,涵盖致病基因突变预测、蛋白质结构与功能预测、高通量药物筛选、GWAS数据再分析等多个领域,一项已获得国际大公司的商业应用。发表论文详见Google Scholar ORCID。目前主要研究方向是结合人工智能技术进行生物医学多组学大数据的多模态融合分析,同时负责“天河二号”的生物医学大数据分析平台建设。
    实验室位于国家超算广州中心,拥有的“天河二号”超级计算机包括17920个节点,峰值运算速度每秒9.50亿亿次,总内存容量约3.4PB,全局存储总容量约19 PB,曾连续六次荣登全球超级计算机五百强榜首;也是最近举行的国际超性能大会中全球唯一Top500、HPCG两个权威榜单都进前三的系统,体现其平衡系统设计的优势。目前已有超过3500个研究组用户,支撑国家级课题超过800多项,涵盖生物医药健康、工业制造、能源材料、智慧城市等多个学科。在2018年发布的根据硬件、软件、服务等超算中心综合评价中,位列全球最具影响力超算中心榜排名第四,也是国内唯一上榜的超算中心。

承担项目

1. 国家海外高层次青年引进人才,200万、主持

2. 基于深度学习的蛋白质空间结构预测方法研究,自然科学基金面上项目 (61772566)、2018-2021、60万、主持

3. 广东省重点研发、精准医学大数据挖掘与整合分析平台研发、2018-2021、800万、共同主持

4. 中大超算应用培育重大专项、基于天河二号的生物多组学大数据融合分析平台、2019-2021、主持

5. 国家重点研发计划、精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发( 2018YFC0910500)、2018-2020 、1475万、项目骨干 (中大负责人)

6. 高性能计算应用支撑平台 、广东省“珠江人才” 创新团队 (2016ZT06D211)、2017-2022、2000万、第二核心成员

7 广东省重点研发、膀胱癌人工智能一体化精准诊断平台的研发、2019-2021、800万、项目骨干

8. Novel antimicrobial target discovery by an integrated approach. 澳大利亚 ARC (LP150100137), 2015-2017 、24.1万澳元 、co-PI

9. Developing species-specific, structure-targeting peptides as a novel class of antibiotics. 澳大利亚NHMRC (1121629), 2017-2019、60.7万澳元、co-PI

组员介绍

研究员&博士后
  • 蔡宇峰 研究员,中国科学技术大学生物学学士、美国麻省大学医学院博士
  • 柴华 博士后、副研究员,澳门科技大学计算机技术 博士(2018)
  • 李雄俊 博士后、副研究员,中山大学工程力学学士、博士(2018)
博士生
  • 周翔 2017级(西北农林科技大学电子工程学士、中山大学计算机科学硕士), 共同指导
  • 张浩洋 2018级 (中山大学公共卫生学士,香港中文大学生物统计硕士)
  • 陈恳 2018级、直博 (北师大化学院)
  • 饶家华 2019级、直博 (中山大学计算机科学,to graduate
  • 袁乾沐 2019级、直博 (中山大学生物学,to graduate
硕士生
  • 陈晟 2018级 (中山大学计算机科学学士)
  • 孙喆 2018级(中山大学软件工程学士)
  • 李永建 2018级 (电子科技大学软件工程学士)
  • 张磐 2019级 (四川大学软件工程,2019, to graduate
  • 黄子旺 2019级 (西安电子科技大学电子工程,2019, to graduate
  • 邓幽扬 2019级 (中南大学)
  • 黄伟林 2019级 (中山大学)
  • 陈健文 2019级 (中山大学)
  • 郑双佳 2016级 (药学院,共同指导)
  • 柯耀斌 2017级 (中山大学生物学学士, 共同指导)
本科生
  • 魏俊康 中山大学药学院
  • 王季宁
  • 张仲岳

人员招聘

实验室长期招聘研究员、博士后、硕士和博士研究生:

1. 特聘研究员:要求38周岁以下,博士学位,有四项以上学术成果(中科院二区或CCF B类及以上论文,如文章优秀项数可适当放宽);工资待遇税前 30-36万+绩效;

2. 特聘副研究员:要求38周岁以下,博士学位,有两项以上学术成果(中科院二区或CCF B类及以上论文);工资待遇税前 19-25万+绩效;

3. 博士后:要求35周岁以下,海内外知名高校或研究机构的博士毕业生;工资待遇税前 20万+绩效;

4. 医学平台开发工程师:本科以上学位,有一定的平台开发经验或较强的编程能力,生物组学分析经验者优先;工资待遇 10万+绩效。

注:绩效根据发表论文和申请基金计算。

目前实验室经费充分,正承担国家青年高层次引进人才、广东省创新团队、国家重点研发、和国家基金委面上等多个项目,需要招聘博士后、特聘副研究员和研究员加入,欢迎有志于科研事业的同学一起奋斗,广告长期有效。 感兴趣的朋友可直接联系 yangyd25 _at_ mail.sysu.edu.cn, 也感谢大家发给感兴趣的同学。