Biomod/2012/TeamSendaiA/Design

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<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> <head> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=utf-8" /> <title>Team Sendai Top</title> <style type="text/css">

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/* コンテナ */ div#Container {width: 800px; margin-left: auto; margin-right: auto}

/* ヘッダー */ div#Header {background-color: #ffffff; padding: 28px 20px 28px}

div#Header h1 {color: #006600;

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/* トップメニュー */ ul#Topmenu {font-size: 1.00em; margin-top: 0; margin-bottom: 30px; margin-left: 0; padding-left: 0; height: 30px; background-color: #006600}

ul#Topmenu li {list-style-type: none; float: left; padding:0; margin:0; display:block}

ul#Topmenu li a {display: block; width: 112px; line-height: 30px; text-decoration: none; text-align: center; color: #ffffff; background-color: #006600; border-right: solid 1px #ffffff}

ul#Topmenu li a:hover {background-color: #009900}

/* フッターメニュー */ ul#Menu2 {font-size: 1.00em; margin-top: 30px; margin-bottom: 2px; margin-left: 0; padding-left: 0; height: 30px; background-color: #006600}

ul#Menu2 li {list-style-type: none; float: left; display:block;}

ul#Menu2 li a {display: block; width: 112px; line-height: 30px; text-decoration: none; text-align: center; color: #ffffff; background-color: #006600; border-right: solid 1px #ffffff}

ul#Menu2 li a:hover {background-color: #009900}

/*目次*/ div#mokuji {width: 800px; margin-left: auto; margin-right: auto; background-color: #f5f5dc}

div#mokuji h2 { background-color: # f5f5dc; font-size: 1.50em; color: #000000; line-height: 45px; padding-left: 12px; margin-bottom: 0}

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/* コンテンツ */ div#Content {width: 800px; margin-left: auto; margin-right: auto}

div#Content h2 { background-color: # f5f5dc; font-size: 1.50em; color: #000000; line-height: 10px; padding-left: 12px; margin-top: 20px; margin-bottom: 0}

div#Content h3 {background-color: #ffffff; background-image: url(maru-skyblue.png); background-repeat: no-repeat; background-position: 0px 2px; font-size: 0.875em; line-height: 22px; padding-left: 26px; margin-top: 30px; margin-bottom: 0; margin-left: 12px; margin-right: 12px}

div#Content p {font-size: 1.25em; line-height: 1.6; margin-top: 10px; margin-left: 12px; margin-right: 12px}

/* フッター */ div#Footer {color: #ffffff; background-color: #006600; margin-top: 0.00px; padding-top: 8px; padding-bottom: 8px}

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</style> </head> <body>

<!-- コンテナ --> <div id="Container">

<!-- ヘッダー --> <div id="Header"> <h1>Team Sendai</h1> <p>Tohoku University</p> </div>

<!—トップメニュー --> <ul id="Topmenu"> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Top">Top</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Design">Design</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Project">Project</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Simulation">Simulation</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Results_%26_Discussion">Experiment</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/BIOMOD/2012/Team_Sendai/Movie">Diary</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Member ">Team</a></li> </ul>

<!-- コンテンツ --> <div id="Content">

<h2>Selector</h2> <p> セレクターは配列の異なる3本の一本鎖DNA群からなっている。<br> セレクターは筒の内部に一列になって生えており、入り口側からSelector1、Selector2、Selector3となっている。<br> </p> <!-- ここにセレクターの配列 -->


<div style="text-align:center;">

<table style="clear:right;width:650px;border-style:solid;border-width:2px;margin:0 auto"> <tr> <th style="width:100px;">Name</th><th style="width:450px;">Sequence(5' to 3')</th><th style="width:100px;">Tm(°C)</th> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">target</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">* - ACTAG<font color="green">TGAG</font><font color="orange">TGCAGCAGTCGTACCA</font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;"></td> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">Selector1</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">AAAAAAAAAAAAAAAAA<font color="red">TGGTAC</font>AAAAAAAA<font color="red">GACTG</font>AAAAAAAA<font color="red">CTGCA</font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">30.6</td> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">Selector2</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">AAAAAAAAAAA<font color="red">TGGTAC</font>AAAA<font color="red">GCTGCA</font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">36.5</td> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">Selector3</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;"><font color="red">TGGTACGACTGCTGCA</font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">62.3</td> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">Selector4</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;"><font color="red">TGGTACGACTGCTGCA<font color="blue">CTCA</font></font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">68.0</td> </tr> </table>


<!-- <table style="clear:right;width:650px;border-style:solid;border-width:2px;margin:0 auto"> <tr> <th style="width:100px;">Name</th><th style="width:450px;">Sequence(5' to 3')</th><th style="width:100px;">Tm(°C)</th> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">target</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">TGCAGCAGTCGTACCA</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;"></td> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">Selector1</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">AAAAAAAAAAAAAAAAA<font color="red">TGGTAC</font>AAAAAAAA<font color="red">GACTG</font>AAAAAAAA<font color="red">CTGCA</font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">29.5</td> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">Selector2</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">AAAAAAAAAAA<font color="red">TGGTAC</font>AAAA<font color="red">GCTGCA</font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">35.1</td> </tr> <tr> <td style="border-style:solid;border-width:1px;">Selector3</td><td style="border-style:solid;border-width:1px;"><font color="red">TGGTACGACTGCTGCA</font></td><td style="border-style:solid;border-width:1px;">62.3</td> </tr> </table> --> </div>


<p style="cleat:both;">

  • 赤色の部分とオレンジ色の部分、青色の部分と緑色の部分がそれぞれ相補な配列となっている<br>
  • 黒い部分は余分につけた部分<br>

<br> Selector1、2はターゲットとなるDNAと一部が相補な配列となっており、間にループ構造となる不要なアデニンの配列が存在する。 また、ループとなる配列はSelector1が2個、Selector2が一個、Selector3はループ構造がなく完全な配列となっており、奥のSelectorほどターゲットのDNAと安定に結合するようになっている。<br> <img src="http://openwetware.org/images/4/45/Suceed.gif" width="350px" height="250px"><br>


</p>

<h2>Tube</h2>


<h2>lipid</h2>


</div>

<!—フッターメニュー --> <ul id="Menu2"> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Top">Top</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Design">Design</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Project">Project</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Simulation">Simulation</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Results_%26_Discussion">Experiment</a></li> <li><a href=" http://openwetware.org/wiki/BIOMOD/2012/Team_Sendai/Movie">Diary</a></li> <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2012/TeamSendaiA/Member ">Team</a></li> </ul>

<!-- フッター --> <div id="Footer"> <address>Copyright (C) Team Sendai, All rights reserved.</address> </div>

</div>

</body> </html>