IGEM:IMPERIAL/2006/project/Oscillator/aiiA/tabels Codon usage table comparision

aiiA gene from Dr Rupert Fray
UUU 27.9(     7)  UCU 15.9(     4)  UAU 35.9(     9)  UGU 15.9(     4)
UUC 15.9(     4)  UCC  4.0(     1)  UAC  8.0(     2)  UGC  0.0(     0)
UUA 59.8(    15)  UCA  4.0(     1)  UAA  0.0(     0)  UGA  0.0(     0)
UUG 19.9(     5)  UCG 12.0(     3)  UAG  4.0(     1)  UGG  4.0(     1)  

CUU 19.9(     5)  CCU 12.0(     3)  CAU 31.9(     8)  CGU 12.0(     3)
CUC  0.0(     0)  CCC  0.0(     0)  CAC  4.0(     1)  CGC  4.0(     1)
CUA  4.0(     1)  CCA 23.9(     6)  CAA  8.0(     2)  CGA  4.0(     1)
CUG  0.0(     0)  CCG 23.9(     6)  CAG 12.0(     3)  CGG  0.0(     0)  

AUU 47.8(    12)  ACU 12.0(     3)  AAU 27.9(     7)  AGU 19.9(     5)
AUC  8.0(     2)  ACC  0.0(     0)  AAC 12.0(     3)  AGC  0.0(     0)
AUA 12.0(     3)  ACA 35.9(     9)  AAA 39.8(    10)  AGA  4.0(     1)
AUG 19.9(     5)  ACG  8.0(     2)  AAG 15.9(     4)  AGG  4.0(     1)

GUU 35.9(     9)  GCU 15.9(     4)  GAU 35.9(     9)  GGU 23.9(     6)
GUC  4.0(     1)  GCC  0.0(     0)  GAC  8.0(     2)  GGC  4.0(     1)
GUA 15.9(     4)  GCA 15.9(     4)  GAA 91.6(    23)  GGA 31.9(     8)
GUG 19.9(     5)  GCG  8.0(     2)  GAG 23.9(     6)  GGG 12.0(     3)

E.coli Codon usage
UUU 23.2( 36738)  UCU  8.7( 13723)  UAU 16.5( 26078)  UGU  5.5(  8732)
UUC 16.9( 26655)  UCC  8.9( 14004)  UAC 12.1( 19205)  UGC  6.9( 10920)
UUA 13.9( 22000)  UCA  7.8( 12368)  UAA  2.0(  3217)  UGA  1.1(  1739)
UUG 14.0( 22187)  UCG  8.7( 13729)  UAG  0.3(   426)  UGG 15.2( 23956)

CUU 11.7( 18500)  CCU  7.3( 11563)  CAU 13.6( 21480)  CGU 20.3( 32051)
CUC 11.0( 17322)  CCC  5.8(  9154)  CAC  9.8( 15491)  CGC 21.0( 33132)
CUA  4.0(  6256)  CCA  8.5( 13508)  CAA 15.0( 23778)  CGA  3.9(  6132)
CUG 50.9( 80431)  CCG 21.8( 34497)  CAG 29.5( 46720)  CGG  6.3(  9988)

AUU 29.8( 47047)  ACU  9.1( 14447)  AAU 18.6( 29427)  AGU  9.5( 14954)
AUC 24.2( 38317)  ACC 22.8( 35978)  AAC 21.4( 33762)  AGC 16.0( 25265)
AUA  5.4(  8612)  ACA  8.2( 12983)  AAA 33.2( 52512)  AGA  2.9(  4662)
AUG 27.0( 42762)  ACG 14.8( 23419)  AAG 10.7( 16855)  AGG  1.9(  3041)

GUU 18.5( 29189)  GCU 15.6( 24685)  GAU 32.1( 50786)  GGU 24.4( 38611)
GUC 15.1( 23896)  GCC 25.1( 39755)  GAC 18.6( 29332)  GGC 27.9( 44073)
GUA 11.1( 17622)  GCA 20.6( 32557)  GAA 38.2( 60421)  GGA  9.0( 14211)
GUG 25.5( 40385)  GCG 31.7( 50058)  GAG 17.7( 27971)  GGG 11.3( 17812)

Registary Aiia
UUU 30.4(     8)  UCU 11.4(     3)  UAU 34.2(     9)  UGU 15.2(     4)
UUC 11.4(     3)  UCC  3.8(     1)  UAC  7.6(     2)  UGC  0.0(     0)
UUA 60.8(    16)  UCA  7.6(     2)  UAA  7.6(     2)  UGA  0.0(     0)
UUG 22.8(     6)  UCG 11.4(     3)  UAG  0.0(     0)  UGG  3.8(     1)

CUU 19.0(     5)  CCU 11.4(     3)  CAU 30.4(     8)  CGU 11.4(     3)
CUC  0.0(     0)  CCC  0.0(     0)  CAC  3.8(     1)  CGC  0.0(     0)
CUA  3.8(     1)  CCA 30.4(     8)  CAA  7.6(     2)  CGA  0.0(     0)
CUG  0.0(     0)  CCG 19.0(     5)  CAG 15.2(     4)  CGG  3.8(     1)

AUU 38.0(    10)  ACU 11.4(     3)  AAU 34.2(     9)  AGU 11.4(     3)
AUC 11.4(     3)  ACC  0.0(     0)  AAC 15.2(     4)  AGC  3.8(     1)
AUA 15.2(     4)  ACA 30.4(     8)  AAA 38.0(    10)  AGA  3.8(     1)
AUG 19.0(     5)  ACG  7.6(     2)  AAG 11.4(     3)  AGG  3.8(     1)

GUU 26.6(     7)  GCU 22.8(     6)  GAU 30.4(     8)  GGU 26.6(     7)
GUC 11.4(     3)  GCC  0.0(     0)  GAC 11.4(     3)  GGC  7.6(     2)
GUA 22.8(     6)  GCA 19.0(     5)  GAA 87.5(    23)  GGA 30.4(     8)
GUG 19.0(     5)  GCG 11.4(     3)  GAG 26.6(     7)  GGG  7.6(     2)