IGEM:Cambridge/2008/Notebook/Turing Pattern Formation/2008/09/11

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RBS screening - We run our PCR products from yesterday on a new 1.8% agarose gel - Gel1 Lane2 : RBSS1 Lane3 : RBS S2 Lane4 : RBS S3 Lane5 : RBS S4 Lane6 : RBS S5 Lane7 : RBS S6 Lane8 : HyperladderIV Lane9 : RBS S7 Lane10 : RBS S8 Lane11 : RBS S9 Lane12 : RBS S10 Lane13 : RBS S6 with VF and VR primers Lane14 : RBS S11 - Gel2 Lane2 : RBSW1 Lane3 : RBS W2 Lane4 : RBS W3 Lane5 : RBS W4 Lane6 : RBS W5 Lane7 : RBS W6 Lane8 : HyperladderIV Lane9 : RBS W7 Lane10 : RBS W8 Lane11 : RBS W9 Lane12 : RBS W10 Lane13 : RBS W6 with VF and VR primers Lane14 : RBS W11 Result - Nothing, except for the PCR with VF and VR primers, either our primers are not right, either we have no insert. RBS screning but single digest - Grow some colonies of Top10 transformed with RBS into 10mL of LB with antibiotic We want to check our transformation with single digest. If we have self ligation in our transformation, we will loose the XbaI cutting site. Backbone for ligation - New pellets in 600μL of SDW - Plasmid miniprep