User:Alexander S Mikheyev/Notebook/rotifer alien genes/2010/03/04

From OpenWetWare
Jump to: navigation, search
OpenWetWare photo.jpg Alien genes <html><img src="/images/9/94/Report.png" border="0" /></html> Main project page
<html><img src="/images/c/c3/Resultset_previous.png" border="0" /></html>Previous entry<html>      </html>Next entry<html><img src="/images/5/5c/Resultset_next.png" border="0" /></html>

Alien Genes New Primer Screen

Lane Gene Lane Gene
1 AV10158 17 AV10084
2 AV10153 18 AV10082
3 AV10151 19 AV10075
4 AV10150 20 AV10071
5 AV10140 21 AV10045
6 AV10134 22 AV10043
7 AV10130 23 AV10042
8 AV10123 24 AV10041
9 AV10121 25 AV10034
10 AV10104 26 AV10028
11 AV10109 27 AV10027
12 AV10099 28 AV10025
13 AV10098 29 AV10016
14 AV10094 30 AV10011
15 AV10092 31 AV10007
16 AV10089 32 AV10002
Reaction mixture conc. 1x x33
Temp (Baltimore C3,E.Windsor A1,A3,Ithaca2 A4,A5,Pennsylvania(PA)B4) ?? 2 66
TopTaq buffer 10x 1 33
dNTP mix 10 mM each 0.2 6.6
Primer mix 5 uM each 0.5
TopTaq (QIAGEN) 5U/ul 0.05 1.65
Milli Q 6.25 206.25
10 ul
PCR cycle
94C 3 min
98C 10 sec
60C 3 min
x35
72C 5 min

Loaded 2.0ul of sample

4Mar'10 Baltimore(C3),E.Windsor(A1,A3).jpg

Loaded 2.0ul of sample

4Mar'10 Ithaca2(A4,A5),Pennsylvania(PA)(B4).jpg

Alien Genes LongPCR

Amplification of AV212_A, AV240_B

' [CONC] 1X 15 '
Water 5.3 79.5
Takara LA Taq 5U 0.1 1.5
Takara LA Buffer 10X 1 15
dNTP 2.5uM each 1.6 24
*Template 1ng 1 15
Primer Mix 5uM each 1
10.0ul 135 9.0ul/RXN
add 1.0 Primer Mix
* AV or CCA3
PCR Cycle
94C 1 min
98C 10 sec
68C 15 min
30X
AMP Lane Template Contents ' Fosmid MIX
1 AV AV10007 FWD AV10011 RVS AV212_A 1
2 AV AV10025 FWD AV10028 RVS AV212_A 4
3 AV AV10004 FWD AV10007 RVS AV212_A 23
4 AV AV10016 FWD AV10020 RVS AV212_A 24
5 AV AV10020 FWD AV10025 RVS AV212_A 25
6 AV AV10029 FWD AV10032 RVS AV240_B 26
7 AV AV10032 FWD AV10034 RVS AV240_B 27
8 AV AV10034 FWD AV10040-1 RVS AV240_B 28
9 AV AV10040-1 FWD AV10041 RVS AV240_B 29
10 AV EU643474 FWD EU643474 RVS AV240_B 30
11 AV AV10045 FWD AV10047 RVS AV240_B 31
12 AV AV10047 FWD AV10049 RVS AV240_B 32
13 AV AV10049 FWD AV10053 RVS AV240_B 33
14 CCA3 AV10007 FWD AV10011 RVS AV212_A 1
15 CCA3 AV10025 FWD AV10028 RVS AV212_A 4
16 CCA3 AV10004 FWD AV10007 RVS AV212_A 23
17 CCA3 AV10016 FWD AV10020 RVS AV212_A 24
18 CCA3 AV10020 FWD AV10025 RVS AV212_A 25
19 CCA3 AV10029 FWD AV10032 RVS AV240_B 26
20 CCA3 AV10032 FWD AV10034 RVS AV240_B 27
21 CCA3 AV10034 FWD AV10040-1 RVS AV240_B 28
22 CCA3 AV10040-1 FWD AV10041 RVS AV240_B 29
23 CCA3 EU643474 FWD EU643474 RVS AV240_B 30
24 CCA3 AV10045 FWD AV10047 RVS AV240_B 31
25 CCA3 AV10047 FWD AV10049 RVS AV240_B 32
26 CCA3 AV10049 FWD AV10053 RVS AV240_B 33

Load 2.0ul sample File:04March10 PCR.tif