User:Alexander S Mikheyev/Notebook/rotifer alien genes/2010/03/02

From OpenWetWare
Jump to: navigation, search
OpenWetWare photo.jpg Alien genes Report.pngMain project page
Resultset previous.pngPrevious entry      Next entryResultset next.png

Alien Gene LongPCR

Amplification of AV212_A, AV_TEL_L_A, AV_240_B

' [CONC] 1X 9 '
Water 5.3 47.7
Takara LA Taq 5U 0.1 0.9
Takara LA Buffer 10X 1 9
dNTP 2.5uM each 1.6 14.4
*Template 1ng 1 9
Primer Mix 5uM each 1
10.0ul 81 9.0ul/RXN
add 1.0 Primer Mix
* AV or CCA3
PCR Cycle
94C 1 min
98C 10 sec
68C 15 min
30X

Loaded 2.0ul of sample File:03March10.tif

AMP Lane Template Contents ' Fosmid MIX
1 CCA3 AV10011 FWD AV10016 RVS AV212_A 2
2 AV AV10011 FWD AV10016 RVS AV212_A 2
3 CCA3 AV10094 FWD AV10098 RVS AV_TEL_L_A 16
4 AV AV10094 FWD AV10098 RVS AV_TEL_L_A 16
5 CCA3 AV10041 FWD AV10042 RVS AV_240_B 17
6 AV AV10041 FWD AV10042 RVS AV_240_B 17
7 CCA3 AV10041 FWD AV10043 RVS AV_240_B 18
8 AV AV10041 FWD AV10043 RVS AV_240_B 18
9 CCA3 AV10041 FWD AV10044 RVS AV_240_B 19
10 AV AV10041 FWD AV10044 RVS AV_240_B 19
11 CCA3 AV10042 FWD AV10045 RVS AV_240_B 20
12 AV AV10042 FWD AV10045 RVS AV_240_B 20
13 CCA3 AV10043 FWD AV10045 RVS AV_240_B 21
14 AV AV10043 FWD AV10045 RVS AV_240_B 21
15 CCA3 AV10044 FWD AV10045 RVS AV_240_B 22
16 AV AV10044 FWD AV10045 RVS AV_240_B 22

Alien Genes New Primer Screen

Lane Gene Lane Gene
1 AV10158 17 AV10084
2 AV10153 18 AV10082
3 AV10151 19 AV10075
4 AV10150 20 AV10071
5 AV10140 21 AV10045
6 AV10134 22 AV10043
7 AV10130 23 AV10042
8 AV10123 24 AV10041
9 AV10121 25 AV10034
10 AV10104 26 AV10028
11 AV10109 27 AV10027
12 AV10099 28 AV10025
13 AV10098 29 AV10016
14 AV10094 30 AV10011
15 AV10092 31 AV10007
16 AV10089 32 AV10002
Reaction mixture conc. 1x x33
Temp (Ithaca1 A2,A3,A5) ?? 2 66
TopTaq buffer 10x 1 33
dNTP mix 10 mM each 0.2 6.6
Primer mix 5 uM each 0.5
TopTaq (QIAGEN) 5U/ul 0.05 1.65
Milli Q 6.25 206.25
10 ul
PCR cycle
94C 3 min
98C 10 sec
60C 3 min
x35
72C 5 min

Loaded 2.0ul of sample

2Mar'10 Ithaca (A2,A3,A5).jpg


Reaction mixture conc. 1x x33
Temp (Ithaca1 A6,B1,B3) ?? 2 66
TopTaq buffer 10x 1 33
dNTP mix 10 mM each 0.2 6.6
Primer mix 5 uM each 1
TopTaq (QIAGEN) 5U/ul 0.05 1.65
Milli Q 5.75 189.75
10 ul
PCR cycle
94C 3 min
98C 10 sec
60C 3 min
x35
72C 5 min

Loaded 2.0ul of sample

2Mar'10 Ithaca (A6,B1,B3).jpg