User:Diogo Amaral/Notebook/Caderno BioMol/2010/04/27
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TP6
Este tipo de segmento é chamado de um palíndromo de DNA, o que significa que ambos os filamentos têm a mesma seqüência de nucleotídeos mas em orientação de polaridade inversa. Enzimas de restrição diferentes cortam em seqüências palindrômicas diferentes. Às vezes os cortes são na mesma posição em cada um dos dois filamentos de polaridade inversa. Entretanto enzimas de restrição mais úteis fazem cortes que são desencontrados
Bam HI: G---GATCC 5' CCTAC---G 3' Hae II: GG---CC 5' CC---GG 3' Eco RI: G---AATTC 5' CTTAA---G 3' Bg III: A---GATCT 5' TCTAG---A 3'
Só com BamHi entre si, pois nos outros 2 casos as sequencias não são complementares!
Os fragmentos cortados com BamHi serão maiores pois ocorreram menos cortes já que uma sequencia de 6pbs aparece com menos frequencia que uma de 4 pbs. Exercicio 2
Correspondem aos corantes da electroforese: azul claro são azul de xilene e azul escuro são azul de bromofenol. Servem como indicador em tempo real(sem ter que recorrer a luz UV) do deslocamento das bandas.
Espero 4 na lane do Plie I e 3 na lane do BglI. Consigo observar só 3 na enzima PlieI, porque 2 fragmentos tem o mesmo comprimento ou muito proximo e se sobrepoem na electroforese.
O tamanho dos poros varia inversamente com a concentração do gel. Quanto menos for o tamanho dos poros maior a resolução da electroforese, ou seja melhor separadas são as bandas.
Fazendo uma recta com o logaritmo do tempo de retençao dos fragmentos e comparado com o tempo de retençao de um marcador de pesos molecualres podia achar o tamanho dos fragmentos.
Sim pois apresenta 6 fragmentos resultantes dos 5 cortes da enzima.
A primeira e a última teem o mesmo numero de moleculas de dna, mas com tamanhos difrentes.
1ª Banda -> 440 ng 2ª Banda -> 73ng
star>A EcoRI corta no nucleotido 500>A HindIII corta no nucleotido 5500>A EcoRI corte no 8000>end no 10000
BamHI
DpnI
HindIII
Gene Normal: inicio-Xpbs-local1-175pbs-local2-201pbs-local3-Xpbs-fim Gene Mutado: inicio-Xpbs-local1-376pbs-local2-Xpbs-fim
Fazer um PCR com uma amostra de DNA, por um pool com a enzima Del e correr uma electroforese depois comparar a distancia percorrida pelos fragmentos para saber se houve ou nao corte da enzima no local 2. Sendo que os fragmentos maiores seriam positivos para a patologia.
individuo saudavel: 3 bandas, que avançavam mais no gel individuo com mutaçao 2 bandas
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