BIOMOL LCS/2010:Schedule

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“De uma coisa temos a certeza: metade do que aprendemos é verdadeiro e a outra metade ou é falsa ou irá ficar rapidamente desactualizada. O problema é que ninguém sabe qual é a metade certa.”

A aprendizagem baseada em problemas (Problem based learning – PBL) é um processo educativo diferente do ensino convencional e tem como objectivo a aquisição de uma base de conhecimento extensa e integrada que seja facilmente recordada e aplicada à análise e resolução de problemas no futuro. Este método assenta no desenvolvimento, por parte do aluno, das capacidades de autoaprendizagem, auto-avaliação, resolução de problemas, e trabalho de equipa.

Neste tipo de ensino, os alunos assumem maior responsabilidade pela sua própria aprendizagem, identificando os conhecimentos que necessitam de aquirir e as fontes onde o podem ir buscar. Desta forma, o aluno tem a oportunidade de construir uma aprendizagem mais dirigida às suas necessidades e interesses individuais. O conhecimento é construido de uma forma iterativa ao longo de várias sessões de discussão em que os alunos apresentam os resultados das suas pesquisas individuais, integram a informação e recebem novos dados do docente.

O docente surge, não como fonte de transmissão de um conhecimento previamente seleccionado, mas como orientador do trabalho dos alunos. O seu papel principal centra-se na escolha de problemas apropriados que permitam a exploração dos conceitos importantes na área de estudo, e no acompanhamento do trabalho dos alunos. Enquanto tutor do processo de aprendizagem, o docente irá fornecendo ou facilitando o acesso à informação requerida pelos alunos, apoiar a integração do conhecimento construído num corpo coerente e participar na avaliação dos progressos efectuados.

Como trabalhar em PBL


No quadro abaixo pode encontrar informação detalhada sobre os conteúdos abordados em cada aula teórica e referências a consultar.

- TUDO O QUE PRECISO PARA ESTUDAR PARA O EXAME! -



Actualizado a 11/06/2010

Data/Aula Conteúdo Tópicos (Cooper) Multimédia Textos de apoio
23/2

Aula 0

Apresentação Funcionamento do curso e utilização do OpenWetWare Openwetware Help Como trabalhar em PBL
2/3

Aula 1

Introdução à Biologia Molecular Parte I: Origens e Aplicações da Biologia Molecular

Biologia Molecular: Origens e Perspectiva Histórica, Objectivos, Conceitos e Aplicações

(Cap. 1: An Overview of Cells and Cell Research, pgs:4-21. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 103-115)

Biologia Molecular - Enciclopédia Stanford de Filosofia Apresentação Aula 1
3/3

Aula 2

Introdução ao Caso de Estudo 1 Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação

Hemoglobina e talassémias.

Definição dos tópicos de investigação.

Alberts online:

Hemoglobina Gene da beta-globina

Caso de Estudo 1
9/3

Aula 3

Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação

Organização dos genes da globina. Talassémias. Mecanismos básicos da transcrição.

(Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes. Cap. 7:RNA Synthesis and Processing, pgs:253-268)

Alberts online:

Cluster dos genes da globina Evolução do cluster da globinaComplementar: Evolução dos genomas

Apresentação Aula 3 Investigação
11/3

Aula 4

Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação Parte II: Expressão da Informação

Regulação da transcrição: Expressão específica de tecido e dependente do desenvolvimento. Regulação da transcrição e diferenciação celular.

(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:268-283)

Scitable:

DNA Footprinting Transcrição e diferenciação celular Alberts online: Controlo da expressão da globina Complementar: como funciona um switch genético

16/3

Aula 5

Caso de Estudo 1 - Que terapias para a Maria? Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação

Mutações e expressão génica. Classificação funcional de mutações pontuais: silent, nonsense, misense. Dominância e recessividade ao nível molecular.

Parte IV: Manipulação da Informação

Introdução à terapia génica.

Scitable:

Terapia génica

-
18/3

Aula 6

Caso de Estudo 1 - Polimorfismo ou mutação? Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação

Origem e papel das mutações: variabilidade genética, evolução e doença. Polimorfismo e Mutação: Frequência vs Consequência. Caracterização experimental dos efeitos de uma variação pontual na expressão génica. Mutações pontuais silenciosas: impacto na expressão génica ao nível do RNA.

Alberts online:

Mutações e evolução

23/3

Aula 7

Processamento do pré-mRNA (splicing) Parte II: Expressão da Informação

O spliceosoma e factores auxiliares. Sequências reguladoras. Mecanismo do splicing. Splicing alternativo – regulação e importância biológica.

(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:290-300)

- Apresentação Aula 7
25/3

Aula 8

Caso de Estudo 1 - integração Parte II: Expressão da Informação

Mutações e splicing: destruição de sequências consenso ou activição de locais de splicing crípticos.

Alberts online:

Mutações causadoras de talassémia

8/4

Aula 9

Caso de Estudo 1 - vida e morte de um mRNA Parte II: Expressão da Informação

Integração dos conceitos. Dinâmica do processo de expressão génica. Exportação e tradução de um mRNA.

(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:301-303. Cap.8: Protein Synthesis, Processing and Regulation, pgs: 309-329)

Animação: Biogénese e tradução de um mRNA Apresentação Aula 9
13/4

Aula 10

Seminários de Investigação:

Docentes convidados - Noélia Custódio, FML e Luisa Romão, INSA

Parte II: Expressão da Informação

Controlo de qualidade na expressão génica. Mecanismos de vigilância transcricionais e pós-transcricional. A via do "nonsense-mediated mRNA decay." Abordagens experimentais em Biologia Molecular.

(Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 118-147)

- Seminário 1

Seminário 2

15/4

Aula 11

Caso de Estudo 1 - controlo de qualidade na beta-talassémia Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação

Integração dos conteúdos abordados. Papel dos mecanismos de controlo de qualidade no fenótipo recessivo/dominante de uma doença hereditária.

- -
20/4

Aula 12

Conclusão do caso de Estudo 1 - uma terapia para a Maria? Parte IV: Manipulação da Informação

Desenvolvimento de novas terapia e ensaios clínicos. Terapias de RNA na modulação da expressão génica.

Ensaio clínico de terapia de morfolinos Apresentação Aula 12
22/4

Aula 13

Apresentação do Caso de Estudo 2 Partes II, III e IV: Expressão e Armazenamento e Transmissão da Informação.

SIDA e HIV.

Definição dos tópicos de investigação.

(Cap. 4: Molecular Medicine: HIV and AIDS, pg: 120)

Caso de Estudo 2
27/4

Aula 14

Caso de Estudo 2 - Ciclo de vida do HIV Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação.

Infecção por HIV: Ciclo de infecção viral e células alvo. Estrutura do vírus HIV. Genoma do HIV. Mecanismo de acção AZT.

(Cap. 3: Key Experiment: Antimetabolites and Chemotherapy, pg: 98. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 115-116. Cap 9. DNA Replication, pgs: 201-211)

- Investigação
29/4

Aula 15

Caso de Estudo 2: Biologia Molecular do HIV Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação.

Estrutura do vírus, entrada na célula, transcrição reversa, integração e expressão. Mecanismos pós-transcricionais de regulação da expressão viral: transporte de RNA, regulação traducional e pós-traducional. Terapias anti-HIV.

(Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 242-244. Cap. 9: The Nucleus, pgs: 361-370)

Animação HIV Alberts

HIVinSite@UCSF

Alberts online: Regulação da tradução por frame-shift

Apresentação Aula 15
4/5

Aula 16

Retrotransposões e elementos móveis Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.

Organização do genoma humano: sequências repetitivas e DNA satélite. Elementos genéticos móveis. Mecanismos de recombinação e transposição.

(Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes, pgs: 161-164. Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 233 e 239-247).

Barbara McClintock e a Descoberta dos Transposões Apresentação Aula 16
6/5

Aula 17

Caso de Estudo 2: Diversidade genética Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.

Mutações, Variabilidade Genética e Selecção Natural. Resistência a Fármacos. Genotipagem - aplicações na clínica, epidemiologia e e estudo da evolução.

HIV, evolução e resistência

Base de dados de resistência do HIV

Artigo/animação - Pandemia H1N1

Alberts online:

Variabilidade Genética Árvores filogenéticas

Apresentação Aula 17
11/5

Aula 18

Caso de Estudo 2: Discussão Parte IV: Transmissão da Informação.

HIV e Linfoma. Definição dos tópicos de investigação.

Alberts online:

Causas do Cancro

-
18/5

Aula 19

Caso de Estudo 2: Bases moleculares do Cancro Parte IV: Transmissão da Informação.

Alterações celulares no Cancro. Desregulação do ciclo celular, apoptose e diferenciação. Oncogenes e Oncossupressores. Retrotransposões e cancro.

(Cap 18: Cancer, pgs 719-741, 744 , 746-750, 753-754))

Animação Criptas Intestinais

Artigo Retrotransposões e cancro

20/5

Aula 20

Caso de Estudo 2: Transcritómica Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.

Diferenciação celular e perfis de expressão génica. Regulação Epigenética. Microarrays. Perfis transcricionais na classificação e prognóstico de tumores.

(Cap. 17: Cell Death and Cell Renewal, pgs 700-708)

Microarrays de DNA Apresentação Aula 20
25/5

Aula 21

Caso de Estudo 2: Novos alvos terapêuticos Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.

Integração dos conceitos explorados: Design dirigido de medicamentos contra novos alvos terapêuticos. Inibidores de cinases e vias de sinalização no tratamento do cancro. Novas fronteiras da Medicina Genómica e Personalizada.

(Cap. 18: Cancer, pgs 755-760. Molecular Medicine: STI-571 Cancer Treatment Targeted against the bcr/abl Oncogene, pg: 759)

- Apresentação Aula 21
27/5

Aula 22

siRNA e microRNAs Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.

Pequenos RNAs não codificantes: descoberta, biogénese e funções celulares. Papel na regulação transcricional e pós-transcricional. Outros tipos de RNAs não codificantes: Xist e a inactivação do cromossoma X. Regulação epigenética e RNA.

(Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 145-147. Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:285-287)

Filme siRNA

siRNAs: Nobel da Medicina 2006

Apresentação Aula 22
1/6

Aula 23

Conclusão do curso: Avaliação contínua e revisões - - -
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