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| <h3><font style="color:#F8B603;">join the lab - bachelor-/masterarbeiten</font></h3> | | <h3><font style="color:#F8B603;">join the lab - bachelor/master candidates and undergraduate internships</font></h3> |
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| wie ihr auf den anderen seiten unserer homepage sehen könnt, interessieren wir uns sehr für die ursachen der natürlichen [http://de.wikipedia.org/wiki/Genetische_Variation genetischen variation] von hormon-responses im pflanzlichen modellorganismus [http://de.wikipedia.org/wiki/Arabidopsis_thaliana ''arabidopsis thaliana'']. arabidopsis linien aus verschiedenen ökologischen/geographischen habitaten ([http://en.wikipedia.org/wiki/Ecotype ökotyp] genannt) reagieren unterschiedlich auf exogen applizierte phytohormone. während ökotyp [http://dbsgap.versailles.inra.fr/vnat/Fichier_passport/Info_generale2.php?value=0 Sap-0] (siehe Abb., Tschechei) schon bei geringen konzentrationen von auxin sein wurzel- oder hypokotylwachstum einstellt, reagiert ökotyp [http://dbsgap.versailles.inra.fr/vnat/Fichier_passport/Info_generale2.php?value=0 Ran] (siehe Abb., Frankreich) wesentlich insensitiver. da die versuche unter kontrolliert konstanten, klimatischen bedingungen stattfinden, müssen die unterschiede genetisch begründet sein. und das ist es, woran wir im grunde interessiert sind:
| | we invite motivated undergraduates with an interest in genetics, molecular biology, computational biology, or plant biology to apply for an internship of a thesis project. |
| ''' welche gene sind für diese natürliche variation verantwortlich?'''<br> [[Image:Diplom-NV.jpg|thumb|335px|right|natürliche genetische variation von auxin responses in der wurzel von arabidopsis ökotypen - workflow [http://www.springerlink.com/content/g71q260r72q47546/ (nach delker et al., 2008)] - click on the pic to enlarge]]
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| diese bislang unbekannten faktoren können auf ebene der biosynthese, der signaltransduktion oder des transports des jeweiligen hormons liegen. es ist aber durchaus denkbar, dass diese direkt beteiligten prozesse innerhalb des weltweiten arabidopsis genpools hochkonserviert sind, so dass die genetischen ursachen der natürlichen variation in nachgeschalteten responsegenen oder interagierenden pathways zu suchen sind.
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| methodisch beinhaltet das ganze:
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| *physiologische hormonassays
| | we have constantly the possibility to design thesis projects with different areas of emphasis such as those mentioned above. |
| *detaillierte [http://de.wikipedia.org/wiki/Sequenzanalyse sequenzanalysen]
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| *identifizierung von genetischen [http://de.wikipedia.org/wiki/Polymorphismus polymorphismen] in einer großen anzahl von kandidatengenen durch extentives data mining
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| *sogenanntes ''phenotyping'' und ''[http://de.wikipedia.org/wiki/Haplotyp haplotyp]''ing von arabidopsis ökotypen
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| du bekommst also einen einblick in zahlreiche molekulargenetische methoden sowohl an der ''[http://en.wikipedia.org/wiki/Wet_laboratory wet bench]'' (=selbst im labor) als auch ''in silico'' im ''[http://en.wikipedia.org/wiki/Dry_lab dry lab]'' (=online data mining).
| | for '''undergraduate trainees''', a minimum commitment of 4-6 weeks full-time is expected. however, we are very flexible and can adapt to your schedule. |
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| auf jeden fall ist es eine aufregende fragestellung (wie wir finden ;o) und wir würden uns freuen, wenn du interesse hast, motivation mitbringst und dir vorstellen kannst, dich einem wichtigen aspekt dieses themas im rahmen deiner bachelor- oder masterarbeit zu widmen.<br>
| | please, contact marcel (mquint at ipb-halle dot de). |
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| ein forschungsgruppenpraktikum in unserem labor bietet dir die möglichkeit uns kennenzulernen und zu checken, ob dir die forschung an unseren themen spass macht.
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