MOLDIAG:Syllabus

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==Conteúdos programático==
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===Introdução ao diagnóstico molecular em medicina===
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*Doenças monogénicas
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*Doenças poligénicas
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*Biologia forense
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#Tipagem Celular por FACS
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#Resistência genética: HIV
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#Virologia
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# Bacteriologia
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#Resistência aos antibióticos
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*Epidemiologia molecular
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# Filogenética
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# Fingerprinting (genotipagem)
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===Bases Biológicas do Diagnóstico Molecular===
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*Estrutura do DNA e RNA
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#Organização do DNA 
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# RNAs codificantes e não codificantes
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# RNA de interferência
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*Expressão genética e síntese proteica
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#Transcrição
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#Maquinaria de transcrição procariótica e eucariótica
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#Edição do RNA
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#Síntese proteica
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#Modificações pós-translacionais
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===Ferramentas do Diagnóstico Molecular===
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*Enzimas que modificam ácidos nucleicos
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*Sistemas e vectores de clonagem
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#Plasmídeos
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#Cosmídeos e fagmídos
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# YACs, BACs
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#Transformação, conjugação, transfeção e electroporação
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*Sistemas de selecção de recombinantes
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#Antibióticos
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# Sistemas auxotróficos
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#Proteínas fluorescentes
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*Sistemas de produção de proteínas recombinantes
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*Bibliotecas genómicas (genotecas)
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*Hibridação de ácidos nucleicos
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# Southern blotting
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====Métodos da baseados na Polimerase====
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*Amplificações pela polimerase
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#RFLP-PCR
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#RAPD-PCR
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#Multiplex PCR
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#PCR In situ
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# Methylation Spectific PCR (MS-PCR)
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*PCR em tempo real
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#Conceitos
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#Syber-green
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#Sondas
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#Curvas de calibração e quantificação
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====Métodos baseados na Ligase e MLPA====
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*Aplicações pela ligase
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# DNA ramificado (bDNA)
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# Comprimento de onda
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# Frequência
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*Fluoróforos
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# Lei de Kasha
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#Desvio de Stokes (Stokes shift)
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#FRET - Förster resonance energy transfer
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#Cromóforos e fluoróforos
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#Quenching
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#Detecção in vivo da interacção de proteínas
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#Sondas moleculares
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*Microscopia
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#Fluoróforos usados em microscopia
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# Photobleaching (decaimento)
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#Métodos para minimizar o decaimento
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#Filtros
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#Microscopia de fluorescência
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#Microscopia confocal
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===Métodos de fluorescência em citogenética===
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*Citogenética clássica vs citogenética convencional
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#Hibridação in situ
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#Sondas e DNA alvo
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## Desnaturação
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## Renaturação / hibridação
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*Preparação da amostra
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#Tipos de material biológico
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#Fixação
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#Pré-tratamento das lâminas
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*Tipos de sonda
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#Sequência repetitiva
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#Chromosome paiting
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*Técnicas especiais de FISH
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# Zoo-FISH
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# Fiber-FISH
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# CGH
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# DNA microarrays / CGH microarrays
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===Diagnóstico citogenético===
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====Citogenética médica clássica====
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====Citogenética de interfase====
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===Genética médica===
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===Diagnóstico molecular hemáto-oncológico===
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===Diagnóstico molecular de doenças infecciosas===
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===Diagnóstico pré-natal===
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This is the wiki for the '''Medical Biochemistry''' is part of a module of ''Molecular and Biochemical Diagnosis'' of MSc in [https://sites.google.com/a/eu.ipp.pt/tecnologiabioquimica/ Biochemical Technology] for [http://www.estsp.ipp.pt ESTSP]. The official language for this course and wiki is Portuguese.
 
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Current revision

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Contents

Conteúdos programático

Introdução ao diagnóstico molecular em medicina

  • Doenças monogénicas
  • Doenças poligénicas
  • Biologia forense
  1. CODIS
  2. STRs
  • Tipagem HLA
  1. Tipagem Celular por FACS
  2. Genotipagem por PCR
  3. Genotipagem por Microarrays
  • Farmacogenómica
  1. Citocromo P450
  • Susceptibilidade a doenças infecciosas
  1. Susceptibilidade genética: SCID
  2. Resistência genética: HIV
  • Doenças infecciosas
  1. Virologia
  2. Bacteriologia
  3. Resistência aos antibióticos
  • Epidemiologia molecular
  1. Filogenética
  2. Fingerprinting (genotipagem)

Bases Biológicas do Diagnóstico Molecular

  • Estrutura do DNA e RNA
  1. Organização do DNA
  2. RNAs codificantes e não codificantes
  3. RNA de interferência
  • Expressão genética e síntese proteica
  1. Transcrição
  2. Maquinaria de transcrição procariótica e eucariótica
  3. Edição do RNA
  4. Síntese proteica
  5. Modificações pós-translacionais

Ferramentas do Diagnóstico Molecular

  • Enzimas que modificam ácidos nucleicos
  • Sistemas e vectores de clonagem
  1. Plasmídeos
  2. Cosmídeos e fagmídos
  3. YACs, BACs
  4. Transformação, conjugação, transfeção e electroporação
  • Sistemas de selecção de recombinantes
  1. Antibióticos
  2. Sistemas auxotróficos
  3. Proteínas fluorescentes
  • Sistemas de produção de proteínas recombinantes
  • Bibliotecas genómicas (genotecas)
  • Hibridação de ácidos nucleicos
  1. Southern blotting
  2. Northern blotting

Métodos da baseados na Polimerase

  • Amplificações pela polimerase
  1. RFLP-PCR
  2. RAPD-PCR
  3. Multiplex PCR
  4. PCR Multiplex alelo específico
  5. PCR Longo
  6. PCR Competitivo
  7. PCR colony
  8. Touchdown (gradiente) e Hot Start
  9. PCR Degenerado
  10. PCR In situ
  11. PCR Inverso
  12. RACE
  13. Nested PCR
  14. RT-PCR / RT-PCR
  15. Methylation Spectific PCR (MS-PCR)
  • PCR em tempo real
  1. Conceitos
  2. Syber-green
  3. Sondas
  4. Curvas de calibração e quantificação

Métodos baseados na Ligase e MLPA

  • Aplicações pela ligase
  1. LCR
  2. MLPA
  • Métodos especiais
  1. DNA ramificado (bDNA)
  2. Ribotipagem

Fundamentos de fluorescência

  • Espectro electromagnético da luz visível
  1. Amplitude de onda
  2. Comprimento de onda
  3. Frequência
  • Fluoróforos
  1. Estado fundamental
  2. Estado excitado
  • Diagrama de Jablonski
  1. Lei de Kasha
  2. Lei de Planck
  3. Desvio de Stokes (Stokes shift)
  4. FRET - Förster resonance energy transfer
  5. Cromóforos e fluoróforos
  6. Quenching
  7. Detecção in vivo da interacção de proteínas
  8. Sondas moleculares
  • Microscopia
  1. Fluoróforos usados em microscopia
  2. Photobleaching (decaimento)
  3. Métodos para minimizar o decaimento
  4. Filtros
  5. Espelhos dicróicos
  6. Microscopia de fluorescência
  7. Microscopia confocal

Métodos de fluorescência em citogenética

  • Citogenética clássica vs citogenética convencional
  1. Hibridação in situ
  2. Sondas e DNA alvo
    1. Desnaturação
    2. Renaturação / hibridação
  • Preparação da amostra
  1. Tipos de material biológico
  2. Fixação
  3. Pré-tratamento das lâminas
  • Tipos de sonda
  1. Sequência repetitiva
  2. Single copy sequences
  3. Chromosome paiting
  • Marcação das sondas
  1. Random primed labelling
  2. PCR
  • Imunodectecção
  1. Marcação directa vs marcação indirecta
  2. Amplificação de sinal
  3. Método ABC
  4. Método Streptavidina-biotina
  • Técnicas especiais de FISH
  1. SKY-FISH
  2. Zoo-FISH
  3. Fiber-FISH
  4. PRINS
  5. CGH
  6. PNA-FISH
  7. DNA microarrays / CGH microarrays
  8. Flow-cytometry FISH

Diagnóstico citogenético

Citogenética médica clássica

Citogenética de interfase

Genética médica

Diagnóstico molecular hemáto-oncológico

Diagnóstico molecular de doenças infecciosas

Diagnóstico pré-natal

Personal tools