Chem 10. 이정아(Jung Ah Lee)

[1] home

gold와 DNA가 감싸진 CNT를 연결

7.22 (WED)

• DNA–CNT hybrids on gold

-http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022072807001945

홈페이지

7.21 (TUE)

• 배경이미지, 각각 그림만 제작하면 교수님이 도와주시기로함
• 참고블로그 http://blog.naver.com/hyoyeol/

spin coating

7.20 (MON)

• 스핀코팅

코팅할 물질의 용액이나 액체 물질을 기질 위에 떨어뜨리고 고속으로 회전시켜 얇게 퍼지게 하는 코팅 방법. 전자 제품 소자의 제조에 많이 사용한다.

스핀 코팅은 UV 경화수지를 광 디스크 표면 등에 코팅하는 방법이다.

스핀코팅(회전도포)은 감광제(광경화성 수지)를 웨이퍼(반도체 기판)에 바를 때 가장 널리 사용되는 기법이다.

스핀 코팅이란 유체를 기 판위에 미리배치 시킨 후, 기판을 매우 빠른 속도로 회전시키면서 원심력에 의해 유체를 펼치게 된다.

• 스핀코터  : 스핀코터는 평평한 웨이퍼나 평판에 얇게 막을 형성하는 것으로 박막 공정의 기본 장비이다. 평판 위에 코팅하고자 하는 물질(PR 또는 액상의 물질)을 놓고 회전을 시키면 얇은 막이 형성된다.

• RPM에 따라서 표면 특성 및 코팅 두께가 변화한다

• 공정

• 장점

-장치가 간단하다. 막 두께가 균일

-용액의 점도, 회전 속도조절가능 -> 막 두께 조절가능

-기공크기, 표면적과 같은 미세구조 제어 용이

-우수한 안정도

• 단점

-분자 배향성이 떨어짐

-기판의 크기제약이 있음

-얇은 박막 제조 시 전하 이동도에 한계

+ 홈페이지

• 서면 sbs아카데미컴퓨터학원 -두달 44만원 단기불가능
• 경대 (하나) - 일러스트랑 홈페이지 23만원 속성으로 2주가능

티셔츠 초안

7.16 (THU)

http://tbay.co.kr/shop/item.php?it_id=F413&NaPm=ct%3Dic5lmzhk%7Cci%3De070cc038b2dd214494b8a726038699d9438e660%7Ctr%3Dslsl%7Csn%3D233267%7Chk%3D12c89e2baae106032e9a861c4e548308f45bcfff

우주배경 티셔츠 + 행성추가

DNA-gold 연결된 논문검색

7.15 (TUE)

nanorod 에 대한 검색 후

DNA오리가미로 검색 방향을 바꾼뒤 검색

HRP붙이는 방법은 이전에 검색 해놓은 논문에서 DNA서열을 가져오고

motor에 붙이는 방법을 검색

7.13 (SUN)

thiolated DNA -Au 연결

야누스 나노 입자를 사용하여 비대칭 나노 클러스터의 조립

DNA 기능화 된 구형의 금 나노 입자 (AuNSs)는 선택적 DNA 혼성화를 통한 DNA 기능화 야누스 나노 입자 (JNP)의 두 개의 서로 다른 반구 상에 부착 될 수있다.

• thiolated DNA 만드는 방법

-http://www.atdbio.com/content/50/Thiol-modified-oligonucleotides

-구입할 수 있다.

thiolated dna on gold

7.8 (WED)

• 원하는 모양

• 0.6M NaCl
• 10nM phosphate buffer
• MilliQ water : 정제수와 증류수는 약간 다른 개념이고 Milli-Q는 정수방식으로 이온물질의 양이나 무기질의 양을 최소화해 증류수를 대체할 수 있는 수준으로 순수한 물을 제조.
• --> 증류수로 대체
• Thiol-modified DNA

• • Au에 Thiolated DNA가 부착

• Thiol-modified oligos can be synthesised by incorporating the thiol modification

during solid-phase phosphoramidite oligonucleotide synthesis, at either the 5′- end or the 3′-end of the oligo

• ---> 원하는 금 위치에 DNA를 붙이는 방법이 더 필요하다.

• DNA서열은 상보가닥의 양 끝에 는 외가닥으로 나올 수 있게 (그림에서 빨간서열) 하여서 -SH기를 달아서 실험
• 노란색가닥에 상보적인 부분에 짧은 상보가닥을 넣어서 HRP를 붙인다.

• 학교책
• Synthesis of thiol-modified peptide nucleic acids designed for post-assembly conjugation reactions

Martijn C. de Koning, Lene Petersen, Jimmy J. Weterings, Mark Overhand, Gijsbert A. van der Marel, Dmitri V. Filippov,

아이디어3

7.7 (TUE)

탄소튜브에 DNA를 이용하여 금속을 부착시켜서 원운동

• DNA interaction with single-walled carbon nanotubes

->CNT를 DNA가 둘러 싸면서 이어가는 방법

• DNA−CNT Nanowire Networks for DNA Detection

-> CNT-DNA-CNT 이어가는 방법

• Polyamine-DNA Interactions. Condensation of Chromatin and Naked DNA

->amine기에 DNA부착방법이 있으니 튜브에 이어서 부착할 수 있지 않을까

• Functionalized Carbon Nanotubes in Drug Design and Discovery

-> 하나가 찾은 논문을 통해서 CNT에 약을 부착하듯이 금속을 부착하도록 발전 , 더 공부하기

7.6 (MON)

https://www.nnfc.re.kr/nanotech/news_v.jsp?me_seq=73&bo_seq=1863&cPage=12&gubn=&words=

비행기표, 티셔츠, 홈페이지

7.3 (FRI)

• 아메리칸항공

인천출발 미국 댈러스 경유 보스톤 약 88만원

• 유나이티드항공

인천출발 미국 샌프란시스코경유 보스톤 약 95만원

• 케세이퍼시픽항공

부산출발 홍콩경유 보스톤 약124만원

• 미국경유 제외하면 홍콩이나 일본경유

• 아이디어 정해지면 티셔츠 디자인하고 PKnanonauts 크게 글자 뽑아서 사진찍기

• 실험 + 홈페이지 + 동영상 돌아가면서 계획짜기

논문공부

Surface Imaging by Self-Propelled Nanoscale Probes

• Fluorescently labeled microtubules are moved by the motor protein kinesin homogeneously adsorbed to a polyurethane (PU) surface coated with casein.
• 2001년논문 운동단백질을 이용한 튜브의 이동

Self-Propelling Nanomotors in the Presence of Strong Brownian Forces
[2]

• Janus nanoparticles (JNPs)
  

병진운동과 회전운동을 동시에 관찰 할 수 있다
방향성과 속도조절을 추가하면 좋을 것, 30nm의 작은 사이즈
NP 크기와 입자 간 간격은 각각 PT-염의 상대적인 양 및 중합체의 소수성 블록의 사슬 길이를 조절하며 제어 할 수있다.
Pt-Au JNPs 의 성장은 약 1시간정도 소요
50 % 물, 글리세롤의 혼합물을 사용하여 JNPs 속도가 느려지게 조절

• DLS

Light scattering Light Scattering의 원리를 응용한 연구 분야는 모두 3분야로서 Dynamic Light Scattering (DLS),
Static Light Scattering (SLS), Electrophortic Light Scattering (ELS)이 있다. DLS는 주로 입자분석에 응용되며, SLS는 고분자의 분자량의 절대분자량측정,
ELS는 ZETA-Potential 의 측정이 응용된다.
3가지 Light Scattering의 차이점은 DLS는 시료 내 입자에 의한 빛의 산란 강도를 측정하는 것이며,
SLS는 광산란에서산란의 방향성 즉 직각방향에서 레이저를 조사하였을 때 ELS는 인위적으로 입자에 전기를 걸어주어 영동의 속도를 레이저로 측정 하는 것이다.
- DLS 0.5nm에서 6um의 입자의 분석이 가능하다. 동적광산란법(DLS)은 유체내의 입자의 유동을 광학적으로 관찰하는 방법.

-> the apparent diffusion constant, as measured by DLS, increases with H2O2 concentration.

• 브라운 운동(Brownian motion)
  

Brown운동이란 액체 중에 부유하는 미립자가 열운동을 하고 있는 액체분자에 끊임없이 충돌하는 불규칙적인 운동
브라운 운동에서 큰 입자는 상대적으로 느리고 높은 온도에서는 빠르게 움직이며
확산 계수로 정의된다. 브라운 운동을 계산하기 위하여 특정 온도에서의 정확한 점도 값이 요구된다.

• Translational and rotational relaxation plot of the 30 nm Pt−Au JNPs in 1 mM sodium citrate solution as measured by dynamic light scattering.
• relaxation time에 따라서 rotation 과 translation을 나타냄.

• size of ∼30 nm, the characteristic length of the Pt−Au Janus nanoparticles approaches the size of larger enzymes
  

이러한 브라운 운동을 substrate-enhanced diffusion of enzyme 처럼 [3] 화학연료로 사용 할 수 있다.

브라운운동하는 야누스나노입자를 수용액 속 입자의 움직임이니 DNA를 붙여서 방향이나 속도를 더 조절할 수 있을지 추후 더 생각해보기

아이디어 더 찾아보기

7.2(THU)

논문공부와 내일오전 논문 더 찾아보기, pdf파일 저장하기, 업로드하기

self propelled nanomotors

[4]

ACS

Surface Imaging by Self-Propelled Nanoscale Probes

JACS

[5]

self propelled micromotors

ACS
Self-Propelled Micromotors for Cleaning Polluted Water

[6]

7.2 (THU)

연료 후 사진 수정한것 !!

아이디어 모식도

7.1 (WED)

--처음에 중합반응하는거 설명추가

monomer : norbornene
촉매 : Grubbs
motor : silicon dioxide 와 금

monomer 속에서의 움직임

이동이 불규칙한 것을 보고 방향과 속도를 조절할 새로운방법 생각

1. 효소를 이용해 펼쳐서 속도를 늦추고 다른방향에서는 계속 이동하여 방향전환

2. 돛을 생각하여 이동을 방해하여서 속도줄이기

아이디어 회의 (발표 3)

7.1 (WED)

RNA 나 DNA로 구조를 디자인해주고 분석해주는 사이트발견
[7] ---nupack
아직 사용 미숙으로 error뜸

트랙을 제외한 움직이는 모터를 만들기로 하고
작동원리,방향,속도,제어등을 토의

Bistate Molecular Switches to Self-Directed Track-Walking Nanomotors

풍차모양에 이용

visible과 UV light 를 이용하여 뒤쪽이 unzipping 앞쪽이 shearing 한방향으로 이동

논문의 Azohairpin 구조를 워커로 바꿔서 다른 조절로 앞뒤 좌우 방향조절 가능성 토론

6.30(TUE)

Recent progress on DNA based walkers

Current Opinion in Biotechnology 2015, 34:56–64 link title

회전하며 워커역할을 하는 구조를 만들때

pyrene과 빛을 이용하여서 walker가 잘리고 다시 붙을 수 있다

pyrene의 존재가 이황화결합을 광분해 하는데 도움을 준다.

지나간 부분의 워커를

빛을 가하며 한방향으로 회전시키는데에 이용할 수 있다.

티셔츠 제작

6.29(MON)

업체에 맡기면 단가가 올라가서

디자인 한것을 잉크젯프린터로 뽑아서

전사지로 옯겨, 다리미로 작업예정

http://www.decal4u.co.kr/

논문공부

6.28 (SUN)

A Synthetic DNA Walker for Molecular Transport

Jong-Shik Shin† and Niles A. Pierce*,†,‡

10834 9 J. AM. CHEM. SOC. 2004

DNAsequences

W : walker strands - 20bp
T : track strands - 15bp
A : attachment strands
D : 분리연료가닥

키네신의 두발보행을 모방하여 합성분자워커를 만들었다.

ATP가수분해로 구동

6.25 (TUE)

G-quadruplex

linker 로 이용해볼지 생각했다.

linker를 G 서열로 바꿔 뭉쳐서 구조를 형성하기 쉽고

C - fuel을 넣어서 펼쳐졌을 유연한 구조를 이용하여

이동을 시켜본다.

6.24 (WED)

DNA duplex–quadruplex exchange as the basis for a nanomolecular machine

Patrizia Alberti and Jean-Louis Mergny*

DNA로 nanomolecular machine을 만들어 F21T folded구조와 C-fuel을 넣어 extended구조로 변하고 overhang이 나타나며
다시 G-fuel을 넣어주면 F21T구조를 형성하고 GC duplex는 버린다.

[http://www.pnas.org