Biomod/2014/Kashiwa/Protocol: Difference between revisions

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   </div>
   </div>
   <div class="CollapsibleBoxBody" id="CBoxBody1">
   <div class="CollapsibleBoxBody" id="CBoxBody1">
       <p>
       <ol>
         1. ～本文～<br>
         <li> ～本文～</li>
         2. ～本文～<br>
         <li> ～本文～</li>
         3. ～本文～<br>
         <li> ～本文～</li>
       </p>
       </ol>
   </div>
   </div>
</div>
</div>

Revision as of 21:20, 19 August 2014

<html> <head> <div id="#top"></div>

<script type="text/javascript" src="http://code.jquery.com/jquery-1.9.1.min.js"></script>

<script type="text/javascript"> new Image(120,80) = "http://openwetware.org/images/7/7a/Logo2Kashiwa.png";

new image(120,80) = "http://openwetware.org/images/1/1d/Logo2.5.png";

new image(71,143) = "http://openwetware.org/images/2/2a/Top1.gif";

new image(71,143) = "http://openwetware.org/images/f/f0/Top2.gif";

new image() = "http://openwetware.org/images/3/38/BackgroundKashiwa.png";

new image() = "http://openwetware.org/images/9/9c/BackgroundKashiwa2.png"; </script>


<script type="text/javascript"> 

  $(function(){
     $("#menu li").hover(function(){
        $("ul",this).show();
     },
     function(){
        $("ul",this).hide();
     });
  });

</script>


<script type="text/javascript"> <!-- if (document.images) {

// 設定開始（使用する画像を設定してください）

// 通常の画像 var img0 = new Image(120,80); img0.src = "http://openwetware.org/images/e/ec/LogoKashiwa.png";

// ポイント時の画像1 var img1 = new Image(120,80); img1.src = "http://openwetware.org/images/2/26/Logo3Kashiwa.png";


// 設定終了

} // ポイント時の処理 function On(name) { if (document.images) { document.images['def'].src = eval(name + '.src'); } } // 放した時の処理 function Off() { if (document.images) { document.images['def'].src = img0.src; } } // --> </script>

<META http-equiv="Content-Style-Type" content="text/css">

<style type="text/css">


.page-back { position: fixed; bottom: 25px; right: 25px;}

p.paragraph { 

 font-size :100%;
 line-height: 135%;
 margin: 10px 25px;

}

p.reference { 

 font-size :90%;
 line-height: 135%;
 margin: 10px 20px;

}

p.indent-paragraph { 

 font-size :110%;
 line-height:1.5;
 margin:0 30px;
 text-indent: 1em;
 }

h1.title a{ 

 font-size :100%;
 display: block;
 text-decoration: none;
 color: #000000;

　font-weight:bolder; 

 border-left: solid 5px #e00000;
 }

h2.reference a{ 

 font-size :90%;
 display: block;
 text-decoration: none;
 border-left: solid 5px;
 }

body { 

 font-size: 12px;
 font-family: Frutiger, Helvetica, Arial;
 background-color: #B5D3FF;
 overflow-y:scroll;
 overflow-x:hidden;

} article { 

 background-color: #ffffff

} .container { 

  background-color: #ffffff;
  margin-top:0px

}

.OWWNBcpCurrentDateFilled {display: none;}

}

  1. column-content

{ 

  width: 0px;
  margin: 0;
  padding: 0;
  float:left;

} .firstHeading { 

  display:none;
  width:0px;

}

  1. globalWrapper

{ 

  width:900px;
  background-color: #ffffff;
  margin-left: auto;
  margin-right: auto;

}

  1. column-one

{ 

  display:none;
  width:0px;
  background-color: #ffffff;

}

  1. content

{ 

  margin: 0px;
  align: center;
  padding: 0px 12px;
  width:876px;
  border: 0;

}

  1. bodyContent

{ 

  width: 800px;
  padding: 0px 38px;
  align: center;
  background-color: #ffffff;
  position:relative;

}

  1. column-content

{ 

  width: 900px;
  background-color: #ffffff;

}


  1. footer

{ 

  position: center;
  width: 900px;

}

div.menubar { 

  position: fixed;
  background-color: none; /* バーの背景色 */
  opacity: 0.95;
  border-top: 0px double white; /* バーの上端線 */
  border-bottom: 0px double white; /* バーの下端線 */
  min-width: 900px; /* メインメニュー全部が収まる最低横幅 */
  z-index:3

}

div.menubar ul#menu { 

  margin: -33px 0px 0px -50px; /* メニューバー外側の余白 */
  padding: 0px; /* メニューバー内側の余白 */
  height: 80px; /* メニューバーの高さ */
  list-style-type: none;

}

div.menubar ul#menu li { 

  min-width: 110px; /* メニュー項目の横幅 */
  height: 80px; /* メニュー項目の高さ(「メニューバーの高さ」と一致させる) */ 
  float: left;
  list-style-type: none;
  list-style-image: none;
  position: relative;

}

div.menubar ul#menu a { 

  text-decoration: none; /* メニュー項目の装飾(下線を消す) */
  display: block; 
  background-color: #1F003E;/* メニュー項目の背景色 */
  color: white; /* メニュー項目の文字色 */
  line-height: 80px; /* メニュー項目のリンクの高さ(「メニュー項目の高さ」と一致させる) */
  text-align: center; /* メインメニューの文字列の配置(中央寄せ) */　
  width: 100%;
  height: 100%;

}

div.menubar ul#menu a:hover { 

  background-image: url("http://openwetware.org/images/3/38/BackgroundKashiwa.png"); /* メニュー項目にマウスが載ったときの背景色 */
  color: #8B008B; /* メニュー項目にマウスが載ったときの文字色 */

}

div.menubar ul#menu a:active { 

  background-image: url("http://openwetware.org/images/3/33/Background2.png"); /* メニュー項目にマウスが載ったときの背景色 */
  color: #8B008B; /* メニュー項目をクリックした時の文字色 */

}

/* メニューバー直後のClearfix */ div.menubar ul#menu { 

  zoom:1;

} div.menubar ul#menu:after { 

  height: 0; visibility: hidden; content: "."; display: block; clear: both;

}

div.menubar ul#menu ul.sub { 

  background-color: #1F003E; /* サブメニュー全体の背景色 */
  border-width: 0px 0px 0px 0px; /* サブメニュー全体の枠線の太さ */
  border-style: solid; /* サブメニュー全体の枠線の線種 */
  border-color: #191970; /* サブメニュー全体の枠線の色 */
  margin: 0px;
  padding: 0px;
  display: none;
  position: absolute;

}

div.menubar ul#menu ul.sub li { 

  width: 110px;
  height: 50px; /* サブメニュー1項目の高さ */
  border-width: 0px 0px 0px 0px; /* サブメニュー1項目の枠線の太さ */
  border-style: solid; /* サブメニュー1項目の枠線の線種 */
  border-color: #191970; /* サブメニュー1項目の枠線の色 */
  z-index: 3

}

div.menubar ul#menu ul.sub li a { 

  line-height: 50px; /* サブメニュー1項目の行の高さ(「サブメニュー1項目の高さ」と合わせる) */
  text-align: center;  /* サブメニュー1項目の項目名の配置(中央寄せ) */
  text-indent: 0px;  /* サブメニュー1項目の項目名前方の余白 */

}

div.menubar ul#menu ul.sub li a:hover { 

  background-image: ('back');
  background-size: 100% auto;
  background-color: #FF00FF; /* サブメニュー項目にマウスが載ったときの背景色 */
  color:  #8B008B; /* サブメニュー項目にマウスが載ったときの文字色 */

}

div.menubar ul#menu ul.sub li a:active { 

  background-image: ('backclick') /* メニュー項目にマウスが載ったときの背景色 */
  backround-size: 100% auto;
  color: #8B008B; /* メニュー項目をクリックした時の文字色 */

}

</style>

<div class="menubar"> 

 <ul id="menu">
 <font face="Frutiger,Helvetica,Arial">
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa"><img src="http://openwetware.org/images/e/ec/LogoKashiwa.png" onmouseover="this.src='http://openwetware.org/images/7/7a/Logo2Kashiwa.png'" onclick="this.src='http://openwetware.org/images/1/1d/Logo2.5.png'" onmouseout="this.src='http://openwetware.org/images/e/ec/LogoKashiwa.png'" height="80px" width="120px" name="def"></a>
   </li>
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Project" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">PROJECT</span></a>
     <ul class="sub">
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Project#1" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Background</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Project#2" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Motivation</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Project#3" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Project Goals</span></a></li>
     </ul>
   </li>
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Trial" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">&nbsp;EARLY TRIAL&nbsp;</span></a>
     <ul class="sub">
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Trial#1" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Design</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Trial#2" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Approaches</span></a></li>
     </ul>
   </li>
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Design" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">DESIGN</span></a>
     <ul class="sub">
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Design#2" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">The Receptor</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Design#1" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">The Motor</span></a></li>
     </ul>
   </li>
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Highlights" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">&nbsp;EXPERIMENT&nbsp;&nbsp;</span></a>
     <ul class="sub">
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Highlights" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Highlights</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Receptor" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">The Receptor</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Motor" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">The Motor</span></a></li>
     </ul>
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Discussion" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">&nbsp;&nbsp;DISCUSSION&nbsp;</span></a>
     <ul class="sub">
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Discussion#1" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Achievements</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Discussion#2" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Future</span></a></li>
     </ul>
   </li>
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Protocols" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">PROTOCOL</span></a>
   </li>
   <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Team" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">TEAM</span></a>
     <ul class="sub">
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Team#1" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Members</span></a></li>
       <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Kashiwa/Team#2" onMouseOver="On('img1')" onMouseOut="Off()"><span style="font-size:12pt;">Sponsors</span></a></li>
     </ul>
   </li>
 </font>
 </ul>

</div> <br> <br> <br> <div class="page-back"><a href="#top"> <img src="http://openwetware.org/images/2/2a/Top1.gif" onmouseover="this.src='http://openwetware.org/images/f/f0/Top2.gif'" onmouseout="this.src='http://openwetware.org/images/2/2a/Top1.gif'" height="150px"/></a></div> </head>


</html>

<html>

<head>

<style> .sample_01{ width: 30%; border-collapse: collapse; } .sample_01 th{ width: 30%; padding: 6px; text-align: left; vertical-align: top; color: #333; background-color: #eee; border: 1px solid #b9b9b9; } .sample_01 td{ padding: 6px; background-color: #fff; border: 1px solid #b9b9b9; } </style>

<script type="text/javascript"><!-- function HideCBox( boxid ) { 

  var target = document.getElementById(boxid);
  if( target.style.display != "none" ) {
     target.style.display = "none";
  }
  else {
     target.style.display = "";
  }

} // --></script>


<style type="text/css"><!-- div.CollapsibleBox { 

  /* ■ボックス全体■ */
  border: 0px solid #4169E1; /* 枠線:濃青 */
  font-size: 100%;             /* 文字サイズ:100% */
  width: 600px;               /* 横幅:390px */

} div.CollapsibleBox div.CollapsibleBoxTitle { 

  /* ■タイトル枠■ */
  background-color: #4B0082; /* 背景色:濃青 */
  color: white;               /* 文字色:白 */
  margin: 0px;
  padding: 0px;
  width: 600px;

} div.CollapsibleBox div.CollapsibleBoxTitle p.cBoxTitle { 

  /* ■タイトル文字列■ */
  font-size: 16px ;          /* 太字 */
  border: 1px solid #4B0082; /* 枠線:濃青 */
  margin: 0px;
  padding: 0px;

} div.CollapsibleBox div.CollapsibleBoxTitle p.cBoxButtons { 

  /* ■ボタン群■ */
  margin: 0px;
  padding: 5px;
  float: right;
  position: relative;

} div.CollapsibleBox div.CollapsibleBoxTitle p.cBoxButtons a img { 

  /* ■ボタンそのもの■ */
  border-width: 0px;    /* リンクの枠線を消す */

} div.CollapsibleBox div.CollapsibleBoxBody { 

  /* ■本文枠■ */
  margin: 0px;
  padding: 0px;
  background-color: #ADD8E6; /* 背景色:淡青 */
  color: #191970; /* 文字色:暗青 */

} div.CollapsibleBox div.CollapsibleBoxBody p { 

  /* ■本文■ */
  margin: 0px;
  padding: 0.5em;   /* 内側の余白:0.5文字分 */

} --></style>


</head>

<body> <font face="Century,Arial" font size="20pt">PROTOCOL</font> <br> <br>

<div class="CollapsibleBox" id="CBoxCover1"> 

  <div class="CollapsibleBoxTitle">
     <p class="cBoxButtons">
        <a href="#" onclick="HideCBox('CBoxBody1');  return false;" title="折りたたみ／復元"><font color="white" font size="2">[show/hide]</font></a>
     </p>
     <p class="cBoxTitle">&nbsp; Contents：</p>
  </div>
  <div class="CollapsibleBoxBody" id="CBoxBody1">
     <ol>
        <li> ～本文～</li>
        <li> ～本文～</li>
        <li> ～本文～</li>
     </ol>
  </div>

</div>

<form> <input type="text" value="show" onclick="hyoji1(0)"> <input type="text" value="hide" onclick="hyoji1(1)"> </form>

<div id="disp">この文章を表示したり消したりします。</div> <script>

function hyoji1(num) { 

 if (num == 0)
 {
   document.getElementById("disp").style.display="block";
 }
 else
 {
   document.getElementById("disp").style.display="none";
 }

}

</script>


<br> <h1 class="title"><a name="contents">&nbsp;1. Receptor</a></h1> <br> 1-1.Receptor monomers are assembled and heterodimerized by Thrombin.

【1:Assembly of receptor】(Barrel ver.) <table class="sample_01"> <tbody> <tr> <th>Reagent</th> <th> </th> </tr> <tr> <td>M13mp18ss</td> <td> </td> </tr> <tr> <td>Staple mix</td> <td> </td> </tr> <tr> <td>10x barrel buffer</td> <td> </td> <tr> <td>MQ</td> <td> </td> </tr> </tr> </tbody> </table>

  • 10x barrel buffer (f:10ml)

1M Tris Baric 0.5μl

0.5M EDTA 200μl

1M MgCl2 2ml

5M NaCl 100μl

MQ 7.2ml

[Procedure]

1. Mix the solutions.

2. The mixture was annealed at 47.5oC for 4 hours.

3. Purified with spin column.

4. Analyzed by 1% agarose gel electrophoresis (100V, 40 min).

【2:Dimerization of hetero receptor by Thrombin】

[Reagent]

Monomer A (purified)

Monomer B (purified)

Thrombin (1.09μM)

Loading-dye

[Procedure]

1. Mix the solutions, and incubated 1 hour at room temperature.

2. Analyzed by 1% agarose gel electrophoresis (100V, 80 min). <h1 class="title"><a name="contents">&nbsp;Contents</a></h1>


挫折。また明日。 </body>

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</html>

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