Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS: Difference between revisions

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<div class="example2">
<div class="example2">


<p><a1 class="image" title="team hokudai"> <a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c0/Title%EF%BC%88%E4%BB%AE%EF%BC%89.png"  width="160" height="80" border="0" /></a></p>
<p><a class="image" title="team hokudai"> <a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c0/Title%EF%BC%88%E4%BB%AE%EF%BC%89.png"  width="160" height="80" border="0" /></a></p>
 
<br>
 
<ul id="menu"> 
 
 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT" href="#">PROJECT</a> 
      <ul> 
      <li>
<a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT#SAKAI">Introduction</a></li> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT#HIROKI" href="#">Term</a></li>
     
<li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT#CHIHIRO" href="#">Goal</a></li>
      </ul> 
      </li> 
 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/DESIGN" href="#">DESIGN</a> 
    <ul> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/DESIGN#IDAN" href="#">DESIGN1</a></li> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/DESIGN#YAMATAKA" href="#">DESIGN2</a></li> 
      </ul>
      </li> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS" href="#"> EXPERIMENTS
                      <br>&RESULTS</a>
    <ul> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#SAKUMA" href="#">Creation of temperature gradient</a></li> 
<li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#YAMADA" href="#">Creation of well-oriented microtubules</a></li> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#SHINJI" href="#">Contraction of well-oriented microtubules</a></li> 
<li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#SHIRAKAWA" href="#">Discussion</a></li>
      </ul> 
        </li> 
 
    <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/FUTURE" href="#"> FUTURE</a> 
    <ul> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/FUTURE"FUKUSHIMA" href="#">Synchronization the dynamics</a></li> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/FUTURE#TOMOKI" href="#">The Far Future</a></li> 
      </ul> 
      </li> 
 
    <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/TEAM#HOKUDAI" href="#"> TEAM</a>
      </li> 
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/SPONSORS#SAKURA" href="#">  SPONSORS</a>   
      </li>
 
</ul>
 




</div>
</div>


<p class="example1"><a2 id="SAKUMA"name="SAKUMA">Creation of temperature gradient</a2></p>
<p class="example111">Process</p>


<nobr>
<p class="example6">
<p class="example111 example2 example3 example4 example5 clearLeft"> <a href="PROJECT">PROJECT</a> <a href="DESIGN">DESIGN</a> <a>EXPERIMENTS&RESULTS</a> <a href="TEAM">TEAM</a> <a href="SPONSORS">SPONSORS</a>  
①Fix black tape on the flow cell.
</nobr>
<br>② Set a flow cell and apply IR　irradiation to the flow cell.
</p>
<br>③ Warm the flow cell for 10 minutes.
<br>④ Measures temperature by using the infrared thermography.<br><br>
 
<p class="example111">Results</p>
<p class="example6"> &nbsp; Temperature gradient was successfully observed around black tape.</p>
 
 
<div class="example8">
 
<p><a class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="http://openwetware.org/images/c/ce/%E6%B8%A9%E5%BA%A6%E5%8B%BE%E9%85%8D%E7%94%BB%E5%83%8F.png"  width="600" height="300" border="0" /></a>
</div>
 
<p class="clearLeft example6">(Figure1:Temperature gradient by IR light)<br><br><br><br>
 
 
<p class="example1"><a2 id="YAMADA"name="YAMADA">Creation of well-oriented microtubules</a2></p>
<p class="example111">Process</p>
 
<p class="example6">①We prepared flow cells by placing a cover glass (18 × 18 mm²; MATSUNAMI) on an another slide glass (26 × 76
<br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; mm²) with a pair of double sided tapes as spacers.  Size of flow cell: 1.5 × 18 × 0.1 mm³(~3 µL) (W × L × H) in
<br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; dimension.
 
<br>② GTP-buffer and tubulin solution were mixed at the ratio of 1 : 4 (Final tubulin concentration: 112.5 µM).
 
<br>③ Tubulin mixture was incubated at 4 °C for 10 minutes to depolymerize it completely. It was confirmed that
<br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; polymerization of tubulin had not been started yet by using a polarizing microscopes.


<br>④ The backside of the area of interest in the flow cell was fixed with a black tape where polymerization of tubulin <br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; would be initiated by IR irradiation.


<br>⑤ A part of the flow cell where black tape was fixed was warmed for 15 minutes by using IR irradiation (IRS-001C; <br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; IR SYSTEM Co., Ltd., 5 V / 1.6 A).


<p class="example7">Process</p>
<p class="example6"><br>① We prepared flow cells by placing a cover glass (18 × 18 mm2; MATSUNAMI) on an another slide glass (26 × 76 mm2) with a pair of double sided tapes as spacers.  Size of flow cell: 1.5 × 18 × 0.1 mm3 (~3 µL) (W × L × H) in dimension.</br>
<br>② GTP-buffer and tubulin solution were mixed at the ratio of 1 : 4 (Final tubulin concentration: 112.5 µM).</br>
<br>③ Tubulin mixture was incubated at 4 °C for 10 minutes to depolymerize it completely. It was confirmed that polymerization of tubulin had not been started yet by using a polarizing microscopes.</br>
<br>④ The backside of the area of interest in the flow cell was fixed with a black tape where polymerization of tubulin would be initiated by IR irradiation. </br>
<br>⑤ A part of the flow cell where black tape was fixed was warmed for 15 minutes by using IR irradiation (IRS-001C; IR SYSTEM Co., Ltd., 5V / 1.6A).</br>
<br>⑥ Microtubules were observed by using fluorescence* microscope and polarizing microscope.</br>
<br>⑥ Microtubules were observed by using fluorescence* microscope and polarizing microscope.</br>
<br>*That time we used TAMRA labeled tubulin.</br>


<div class="example1">
<br>*That time we used TAMRA labeled tubulin.


<p><a  class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e1/IR%E6%9C%80%E7%B5%82%E7%89%88.JPG"  width="600" height="400" border="0" /></a>
<div class="example6">
 
<p><a  class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e1/IR%E6%9C%80%E7%B5%82%E7%89%88.JPG"  width="800" height="450" border="0" /></a>
</div>
</div>
<p class="clearLeft">(Figure1:Iradiation to the flow cell by IR light)<br><br>


<p class="example7 clearLeft">Results</p>
<p><br>&nbsp;</p>
<p class="clearLeft example6">(Figure2:Iradiation to the flow cell by IR light)<br><br>


<p><a  class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e3/%E5%81%8F%E5%85%89%E9%A1%95%E5%BE%AE%E9%8F%A1.JPG"  width="450" height="400" border="0" /></a>
<p class="example111 clearLeft">Results</p>
<p class="example6"> &nbsp; Well-oriented microtubules was successfully formed under temparature
gradient using photo irradiation.<br></p>
 
<div class="example6">
 
<p><a  class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/22/%E9%85%8D%E5%90%91%E5%BE%AE%E5%B0%8F%E7%AE%A1.png/799px-%E9%85%8D%E5%90%91%E5%BE%AE%E5%B0%8F%E7%AE%A1.png"  width="450" height="400" border="0" /></a>
<a  class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/40/%E8%9B%8D%E5%85%89%E9%A1%95%E5%BE%AE%E9%8F%A1.jpg"  width="450" height="400" border="0" /></a></p>
<a  class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/40/%E8%9B%8D%E5%85%89%E9%A1%95%E5%BE%AE%E9%8F%A1.jpg"  width="450" height="400" border="0" /></a></p>
</div>


<p class="clearLeft">(Figure2:Polarising microscopic(left),fluorescence microscopic
<p class="clearLeft example6">(Figure3:Polarising microscopic(left),fluorescence microscopic
(right) image of well-oriented microtubules)<br>
(right) image of well-oriented microtubules)<br><br><br><br>
Well-oriented microtubules was successfully formed under temparature
gradient using photo irradiation.
</p>
</p>
<p class="clearLeft example1">
<a2 id="SHINJI"name="SHINJI">Contraction of well-oriented microtubules</a2></p>
<p class="example111">Process</p>
<p class="example6">①We added 0.5 μL of streptavidin (0.5 μM) with 5 μL of kinesin (2.0 μM) and
prepared a kinesin tetramer solution.
<br>②We then prepared ATP Buffer.
<br>③The kinesin tetramer solution was added to form the well-oriented microtubules through
preferential
<br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; polymerization and left it for 5 minutes to diffuse the tetramer kinesin through
the solution.
<br>④We next added ATP Buffer to make a contraction of the well-oriented microtubules
<br>⑤Finally we observed the contraction of well-oriented microtubules under cross-polarizing
microscope.<br><br>
<p class="example111">Results</p>
<p class="example6"> &nbsp; From the movie, we observed the contraction of well-oriented microtubules caused by the
action of kinesin tetramers.</p>
<div class="example6">
<p><a  class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/50/1414277897IY0kj4I1TJeAMpJ1414277869.gif/800px-1414277897IY0kj4I1TJeAMpJ1414277869.gif"  width="600" height="400" border="0" /></a>
</div>
<p class="clearLeft example6">(Figure4:Contraction of well-oriented microtubule)
<br>&nbsp;
</p><br><br>




<p class="example1"><a2 id="SHIRAKAWA"name="SHIRAKAWA">Dissucussion</a2></p>
<p class="example6"> &nbsp; Our latest experiment revealed that the contraction speed of the well-oriented microtubule
were not so fast. So, our next target is to raise the speed of contraction to make it useful
for practical applications, To achieve this we are planning to design multiple contraction unit
composed of sequential microtubules and Multimeric kinesin arrangements.</p>


</body>
</body>


</html>
</html>

Latest revision as of 06:28, 27 October 2014

<html> <head>

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/* --- タイプ1 デザイン2 --- */


/* --- 全体の背景・テキスト --- */ body { margin: 0; padding: 0; background: #1C6ECD url(../image/pageback_gray_gradation.gif) repeat-x top; /* 全体の背景（グラデーション） */ color: #000000; /* 全体の文字色 */ font-size: 80%; /* 全体の文字サイズ */ }

/* --- ここから原文通り --- */ p.example1 { font: 230% Times New Roman; } p.example2 { text-align: center; } p.example3 { word-spacing: 1em; } p.example4 { line-height: 6em; } p.example5 { text-decoration: underline overline; } p.example6 { font: 130% Times New Roman; } p.example7 { font: 150% Times New Roman; } p.example11 { font: 160% Times New Roman; } p.example12 { text-align: left;} p.example111 { font: 180% Times New Roman; } p.example13 { Times New Roman }

div.example1 { width: 1000px; height: 500px; background-color: #ffffff; float: center; }


div.example2 { width: 1000px; height: 200px; background-color: #ffffff; margin: 0px 0px 0px 0px; float: left; }

div.example3 { width: 200px; height: 150px; background-color: #ffffff; float: center; }

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div.example8 { width: 600px; height: 300px; background-color: #ffffff; float: center; }

.clearLeft { clear: left; }

a1:hover {opacity:0;}

/* ulリセット */ .menu-, .menu-list { 

 list-style: none;
 padding-left: 0;
 margin: 0;

} /* メニューを横並びに */ .menu-case { 

 float: left;

} .menu-:after { 

 content: "";
 clear: both;
 display: block;

} /* 子メニュー分の高さを除く */ .menu-list { 

 position: absolute;
 opacity: 0;
 z-index: -1;
 width: 10em;

} /* 子メニューを表示 */ .menu-name:hover + .menu-list, .menu-list:hover { 

 opacity: 1;
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} /* ホバー時、メニュー名の色変更 */ .menu-case:hover .menu-name { 

 color: #507ea4;

}





/* --- ここまで --- */


/* --- ヘッダとフッタのリンクテキスト --- */ a:link { color: #blue; } a:visited { color: #red; } a:hover { color: #black; } a:active { color: #black; }

/* --- コンテンツ内のリンクテキスト --- */

  1. content a:link { color: #red; }
  2. content a:visited { color: #red; }
  3. content a:hover { color: #black; }
  4. content a:active { color: #black; }

/* --- コンテナ --- */

  1. container {

width: 1000px; /* コンテナの幅 */ margin: 0 auto; /* センタリング */ background: url(../image/pageback_880_gray.gif) no-repeat center top; /* コンテナの背景（両サイドの影） */ }

/* --- ページ --- */

  1. page {

width: 1000px; /* ページの幅 */ margin: 0 auto; /* センタリング */ background-color: #ffffff; /* ページの背景色 */ border-left: 1px #505050 solid; /* ページの左境界線 */ border-right: 1px #505050 solid; /* ページの右境界線 */ }


/* --- ▼ヘッダ内の設定開始 --- */

/* --- ヘッダ --- */

  1. header {

position: relative; /* 相対配置（ガイドメニューのために設定） */ width: 100%; /* IE 6のために幅の指定が必要 */ margin-bottom: 12px; /* ヘッダの下マージン */ padding: 15px 0 8px; /* ヘッダのパディング（上、左右、下） */ background-color: #ffffff; /* ヘッダの背景色 */ border-bottom: 1px #4b4b4b solid; /* ヘッダの下境界線 */ }

/* --- サイトタイトル --- */

  1. header h1.siteTitle,
  2. header p.siteTitle {

margin: 0 19px 7px; /* サイトタイトルのマージン（上、左右、下） */ font-size: 200%; /* サイトタイトルの文字サイズ */ color: #eee8aa; /* サイトタイトルの文字色 */ } /* サイトタイトルの画像 */

  1. header h1.siteTitle img,
  2. header p.siteTitle img {

border: none; }

/* --- キャッチフレーズ --- */

  1. header p.catch {

margin: 0 22px 10px; /* キャッチフレーズのマージン（上、左右、下） */ color: #808080; /* キャッチフレーズの文字色 */ }

  1. header p.catch strong {

font-weight: normal; /* 文字の太さ（ノーマル） */ }

/* --- ガイドメニュー --- */

  1. header ul.guide {

position: absolute; /* 絶対配置 */ top: 30px; /* 上からの距離 */ right: 20px; /* 右からの距離 */ margin: 0; padding: 0; list-style-type: none; } /* メニュー項目 */

  1. header ul.guide li {

display: inline; padding: 0 4px 0 8px; /* 項目のパディング（上右下左） */ background: url(../image/menu_line_gray.gif) no-repeat left; /* 項目の背景（区切り線） */ } /* 最初の項目 */

  1. header ul.guide li.first {

background: none; /* 区切り線なし */ }

/* --- オープニングエリア（トップページ） --- */

  1. header div.opening {

width: 1000px; margin: 0 auto 2px; /* オープニングエリアのマージン（上、左右、下） */ } /* オープニングエリア内の見出し */

  1. header div.opening h2 {

margin: 0; }

/* --- ヘッダメニュー --- */

  1. header ul.nl {

width: 1000px; /* ヘッダメニューの幅 */ margin: 0 auto; /* センタリング */ padding: 0; background: #ffffff url(../image/hor_menu5_off.gif) repeat-x top; /* ヘッダメニューの背景 */ border: #aca36a solid; /* ヘッダメニューの境界線（色、スタイル） */ border-width: 2px 3px; /* ヘッダメニューの境界線の太さ（上下、左右） */ list-style-type: none; text-align: center; } /* メニュー項目 */

  1. header ul.nl li {

width: 139px; /* 項目の幅 */ float: left; line-height: 100%; } /* リンクエリア */

  1. header ul.nl li a {

display: block; position: relative; /* IE6用 */ padding: 13px 2px 5px; /* リンクエリアのパディング（上、左右、下） */ border: 1px solid; /* リンクエリアの境界線（太さ、スタイル） */ border-color: #e4d6b8 #8b7e63 #8b7e63 #e4d6b8; /* リンクエリアの境界線色（上右下左） */ text-decoration: none; /* テキストの下線（なし） */ font-weight: bold; /* 文字の太さ（太字） */ color: #ffffff; /* 文字色 */ } /* 英字部分 */

  1. header ul.nl li a span.en {

display: block; margin-top: 2px; /* 英字部分の上マージン */ font-size: 85%; /* 英字の文字サイズ */ font-weight: normal; /* 文字の太さ（ノーマル） */ color: #eee8aa; /* 英字の文字色 */ } /* ポイント時とアクティブ時の設定 */

  1. header ul.nl li a:hover,
  2. header ul.nl li.active a {

background: #b6a57f url(../image/hor_menu5_on.gif) repeat-x top; /* ポイント時（アクティブ時）の背景 */ color: #f4efc4; /* ポイント時（アクティブ時）の文字色 */ }

  1. header ul.nl li a:hover span.en,
  2. header ul.nl li.active span.en {

color: #fde337; /* ポイント時（アクティブ時）の英字の文字色 */ }


/* --- ▼コンテンツ内の設定開始 --- */

/* --- コンテンツ --- */

  1. content {

width: 1000px; /* コンテンツの幅 */ margin: 0 auto; /* センタリング */ padding-top: 20px; /* コンテンツの上パディング */ background: #ffffff url(../image/content_top_gray.gif) no-repeat top; /* コンテンツの背景 */ }


/* --- ▼メインカラム内の設定開始 --- */

/* --- メインカラム --- */

  1. main {

float: right; width: 1000px; /* メインカラムの幅 */ }

/* --- ページタイトル（下層ページ） --- */ /* 見出しエリア */

  1. main div.pageTitle {

margin: 0 20px 15px; /* 見出しエリアのマージン（上、左右、下） */ padding: 23px 15px; /* 見出しエリアのパディング（上下、左右） */ background: #f0e8c7 url(../image/heading_back4.gif) repeat-x top; /* 見出しエリアの背景 */ } /* 見出し */

  1. main div.pageTitle h1 {

margin: 0; font-size: 160%; /* 見出しの文字サイズ */ line-height: 100%; }

/* --- セクション（共通設定） --- */

  1. main div.section {

margin: 0 20px 3em; /* セクションのマージン（上、左右、下） */ }

/* --- 標準セクション --- */ /* 見出しエリア */

  1. main div.normal div.heading {

margin-bottom: 1.2em; /* 見出しエリアの下マージン */ padding: 4px 2px; /* 見出しエリアのパディング（上下、左右） */ border-bottom: 1px #999999 solid; /* 見出しエリアの下境界線 */ } /* 見出し */

  1. main div.normal div.heading h2 {

margin: 0; padding: 2px 0 1px 5px; /* 見出しのパディング（上右下左） */ border-left: 5px #b6a57f solid; /* 見出しの左境界線 */ font-size: 130%; /* 見出しの文字サイズ */ line-height: 100%; } /* 段落 */

  1. main div.normal p {

margin: 0 5px 1em; /* 段落のマージン（上、左右、下） */ line-height: 160%; /* 行の高さ */ }

/* --- 強調セクション --- */

  1. main div.emphasis {

padding: 1.1em 15px 0; /* セクションのパディング（上、左右、下） */ background-color: #ffffff; /* セクションの背景色 */ border: 1px #d8c89d solid; /* セクションの境界線 */ } 

/* 見出し */
  1. main div.emphasis h2 {

margin: 0 0 0.8em; /* 見出しのマージン（上、左右、下） */ font-size: 130%; /* 見出しの文字サイズ */ color: #dc3900; /* 見出しの文字色 */ } 

/* 段落 */
  1. main div.emphasis p {

margin: 0 0 1em; /* 段落のマージン（上、左右、下） */ color: #2b2b2b; /* 段落の文字色 */ line-height: 150%; /* 行の高さ */ }

/* --- 新着情報（トップページ） --- */

  1. main div.update dl {

width: 580px; /* 新着情報の幅（メインカラムの幅から50px引いた値） */ margin: 0 auto; /* センタリング */ } /* 日付エリア */

  1. main div.update dt {

width: 6.7em; /* 日付エリアの幅 */ float: left; padding: 7px 0 6px 3px; /* 日付エリアのパディング（上右下左） */ line-height: 120%; /* 行の高さ */ } /* 本文エリア */

  1. main div.update dd {

margin: 0; padding: 7px 3px 6px 6.6em; /* 本文エリアのパディング（上右下左） */ border-bottom: 1px #ffffff dotted; /* 本文エリア下境界線 */ line-height: 120%; /* 行の高さ */ }

/* --- ▲メインカラム内の設定終了 --- */


/* --- ▼サイドバー内の設定開始 --- */

/* --- サイドバー --- */

  1. nav {

float: right; width: 200px; /* サイドバーの幅 */ padding-left: 10px; /* サイドバーの左パディング */ }

/* --- セクション（共通設定） --- */

  1. nav div.section {

padding-bottom: 5px; /* セクションの下パディング */ background-color: #f6f0d4; /* セクションの背景色 */ } /* 見出しエリア */

  1. nav div.heading {

margin: 0 0 0.7em; /* 見出しエリアのマージン（上、左右、下） */ padding: 5px; /* 見出しエリアのパディング */ background: #3f3f3f url(../image/heading_back_gray3.gif) repeat-x top; /* 見出しエリアの背景 */ border: 1px #666666 solid; /* 見出しエリアの境界線 */ } /* 見出し */

  1. nav div.section h2 {

margin: 0; padding: 2px 0 2px 7px; /* 見出しのパディング（上右下左） */ border-left: 4px solid; /* 見出しの左境界線（太さ、スタイル） */ font-size: 100%; /* 見出しの文字サイズ */ color: #f9f9f9; /* 見出しの文字色 */ line-height: 100%; } /* 段落 */

  1. nav div.section p {

margin: 0 5px 0.7em; /* 段落のマージン（上、左右、下） */ line-height: 130%; /* 行の高さ */ }

/* --- 標準セクション（グレー） --- */ /* 見出し */

  1. nav div.normal h2 {

border-left-color: #c0c0c0; /* 左境界線の色 */ }

/* --- 強調セクション1（水色） --- */ /* 見出し */

  1. nav div.emphasis h2 {

border-left-color: #add8e6; /* 左境界線の色 */ }

/* --- 強調セクション2（黄色） --- */ /* 見出し */

  1. nav div.strong h2 {

border-left-color: #fde337; /* 左境界線の色 */ }

/* --- サブメニュー --- */ /* 見出しエリア */

  1. nav div.subMenu div.heading {

margin: 0; /* 見出しエリアのマージン（上書き） */ } /* 見出し */

  1. nav div.subMenu h2 {

border-left-color: #add8e6; /* 左境界線の色 */ } /* メニューエリア */

  1. nav div.subMenu ul.nl {

margin: 1px 0 0; /* メニューエリアのマージン（上、左右、下） */ padding: 0; border: 1px #666666 solid; /* メニューエリアの境界線 */ list-style-type: none; } /* メニュー項目 */

  1. nav div.subMenu ul.nl li {

border-top: 1px #808080 solid; /* 項目の上境界線 */ border-bottom: 1px #404040 solid; /* 項目の下境界線 */ } /* リンクエリア */

  1. nav div.subMenu ul.nl li a {

display: block; position: relative; /* IE6用 */ padding: 14px 10px; /* リンクエリアのパディング（上下、左右） */ background: #3f3f3f url(../image/ver_menu4_off.gif) repeat-x top; /* リンクエリアの背景 */ color: #e0e0e0; /* 文字色 */ text-decoration: none; /* テキストの下線（なし） */ } /* ポイント時の設定 */

  1. nav div.subMenu ul.nl li a:hover {

background: #505050 url(../image/ver_menu4_on.gif) repeat-x top; /* ポイント時の背景 */ text-decoration: underline; /* テキストの下線（あり） */ }

/* --- お問い合わせ --- */

  1. nav div.contact {

padding-bottom: 0.3em; /* セクションの下パディング */ } /* 段落 */

  1. nav div.contact p {

margin-bottom: 0.4em; /* 段落の下マージン（上書き） */ }

/* リンクエリア */

  1. nav div.contact p.form a {

display: block; position: relative; /* IE6用 */ padding: 12px 2px; /* リンクエリアのパディング（上下、左右） */ background: #3f99b3 url(../image/form_back1_off.gif) repeat-x top; /* リンクエリアの背景 */ font-size: 110%; /* リンクエリアの文字サイズ */ font-weight: bold; /* 文字の太さ（太字） */ color: #ffffff; /* リンクエリアの文字色 */ text-decoration: none; /* テキストの下線（なし） */ } /* ポイント時の設定 */

  1. nav div.contact p.form a:hover {

background: #54b3cf url(../image/form_back1_on.gif) repeat-x top; /* ポイント時の背景 */ }

/* --- ▲サイドバー内の設定終了 --- */


/* --- 罫線 --- */

  1. content hr.clear {

clear: right; /* 右フロートのクリア */ width: 100%; margin: 0; visibility: hidden; /* 非表示 */ }

/* --- ▲コンテンツ内の設定終了 --- */



/* --- ▼その他の設定開始 --- */

/* --- clearfix --- */ .clearFix:after { content: "."; display: block; height: 0; clear: both; visibility: hidden; } .clearFix { min-height: 1px; }

/* --- ▲その他の設定終了 --- */


  1. column-one { display:none; width:0px;}
  2. footer { display:none; width:0px;}

.firstHeading { display:none; width:0px;}

  1. contentSub { display:none; width:0px;}


.container{background-color: #ffffff; margin-top:0px} .OWWNBcpCurrentDateFilled {display: none;}


<style type="text/css">

  1. menu{
 list-style-type: none;
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 border-radius: 5px 5px 5 5;
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}

  1. menu li{
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 text-align: center;

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  1. menu li a{
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 padding: 15px 0 11px;
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 font-weight: bold;
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 text-decoration: none;

}

  1. menu li:hover > a{
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  1. menu > li:hover > a{
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  1. menu li ul{
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  1. menu li ul li a{
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<!-- BODY { 

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</style> </head> </html>

<html lang="ja">

<head> 

<meta charset="UTF-8">
<title>team hokudai</title>


</head>

<body>

<div class="example2">

<p><a class="image" title="team hokudai"> <a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c0/Title%EF%BC%88%E4%BB%AE%EF%BC%89.png" width="160" height="80" border="0" /></a></p>

<br>

<ul id="menu"> 


      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT" href="#">PROJECT</a>  
      <ul>  
      <li>

<a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT#SAKAI">Introduction</a></li> 

      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT#HIROKI" href="#">Term</a></li>

<li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/PROJECT#CHIHIRO" href="#">Goal</a></li> 

      </ul>  
      </li>  

     <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/DESIGN" href="#">DESIGN</a>  
    <ul>  
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/DESIGN#IDAN" href="#">DESIGN1</a></li>  
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/DESIGN#YAMATAKA" href="#">DESIGN2</a></li>  
      </ul> 
      </li>  

     <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS" href="#"> EXPERIMENTS 
                     <br>&RESULTS</a>
    <ul>  
      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#SAKUMA" href="#">Creation of temperature gradient</a></li>

<li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#YAMADA" href="#">Creation of well-oriented microtubules</a></li> 

      <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#SHINJI" href="#">Contraction of well-oriented microtubules</a></li>  
<li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/EXPERIMENTS&RESULTS#SHIRAKAWA" href="#">Discussion</a></li>
      </ul>  
       </li>  

    <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/FUTURE" href="#"> FUTURE</a>  
    <ul>  
     <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/FUTURE"FUKUSHIMA" href="#">Synchronization the dynamics</a></li>  
     <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/FUTURE#TOMOKI" href="#">The Far Future</a></li>  
     </ul>  
     </li>  

    <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/TEAM#HOKUDAI" href="#"> TEAM</a> 
      </li>  
     <li><a href="http://openwetware.org/wiki/Biomod/2014/Hokudai/SPONSORS#SAKURA" href="#">  SPONSORS</a>    
      </li> 

</ul>


</div>

<p class="example1"><a2 id="SAKUMA"name="SAKUMA">Creation of temperature gradient</a2></p> <p class="example111">Process</p>

<p class="example6"> ①Fix black tape on the flow cell. <br>② Set a flow cell and apply IR　irradiation to the flow cell. <br>③ Warm the flow cell for 10 minutes. <br>④ Measures temperature by using the infrared thermography.<br><br>

<p class="example111">Results</p> <p class="example6"> &nbsp; Temperature gradient was successfully observed around black tape.</p>


<div class="example8">

<p><a class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="http://openwetware.org/images/c/ce/%E6%B8%A9%E5%BA%A6%E5%8B%BE%E9%85%8D%E7%94%BB%E5%83%8F.png" width="600" height="300" border="0" /></a> </div>

<p class="clearLeft example6">(Figure1:Temperature gradient by IR light)<br><br><br><br>


<p class="example1"><a2 id="YAMADA"name="YAMADA">Creation of well-oriented microtubules</a2></p> <p class="example111">Process</p>

<p class="example6">①We prepared flow cells by placing a cover glass (18 × 18 mm²; MATSUNAMI) on an another slide glass (26 × 76 <br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; mm²) with a pair of double sided tapes as spacers. Size of flow cell: 1.5 × 18 × 0.1 mm³(~3 µL) (W × L × H) in <br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; dimension.

<br>② GTP-buffer and tubulin solution were mixed at the ratio of 1 : 4 (Final tubulin concentration: 112.5 µM).

<br>③ Tubulin mixture was incubated at 4 °C for 10 minutes to depolymerize it completely. It was confirmed that 

<br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; polymerization of tubulin had not been started yet by using a polarizing microscopes.

<br>④ The backside of the area of interest in the flow cell was fixed with a black tape where polymerization of tubulin <br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; would be initiated by IR irradiation.

<br>⑤ A part of the flow cell where black tape was fixed was warmed for 15 minutes by using IR irradiation (IRS-001C; <br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; IR SYSTEM Co., Ltd., 5 V / 1.6 A).

<br>⑥ Microtubules were observed by using fluorescence* microscope and polarizing microscope.</br>

<br>*That time we used TAMRA labeled tubulin.

<div class="example6">

<p><a class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e1/IR%E6%9C%80%E7%B5%82%E7%89%88.JPG" width="800" height="450" border="0" /></a> </div>

<p><br>&nbsp;</p> <p class="clearLeft example6">(Figure2:Iradiation to the flow cell by IR light)<br><br>

<p class="example111 clearLeft">Results</p> <p class="example6"> &nbsp; Well-oriented microtubules was successfully formed under temparature gradient using photo irradiation.<br></p>

<div class="example6">

<p><a class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/22/%E9%85%8D%E5%90%91%E5%BE%AE%E5%B0%8F%E7%AE%A1.png/799px-%E9%85%8D%E5%90%91%E5%BE%AE%E5%B0%8F%E7%AE%A1.png" width="450" height="400" border="0" /></a> <a class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/40/%E8%9B%8D%E5%85%89%E9%A1%95%E5%BE%AE%E9%8F%A1.jpg" width="450" height="400" border="0" /></a></p> </div>

<p class="clearLeft example6">(Figure3:Polarising microscopic(left),fluorescence microscopic (right) image of well-oriented microtubules)<br><br><br><br> </p>

<p class="clearLeft example1"> <a2 id="SHINJI"name="SHINJI">Contraction of well-oriented microtubules</a2></p> <p class="example111">Process</p>


<p class="example6">①We added 0.5 μL of streptavidin (0.5 μM) with 5 μL of kinesin (2.0 μM) and prepared a kinesin tetramer solution.

<br>②We then prepared ATP Buffer.

<br>③The kinesin tetramer solution was added to form the well-oriented microtubules through preferential <br> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; polymerization and left it for 5 minutes to diffuse the tetramer kinesin through the solution.

<br>④We next added ATP Buffer to make a contraction of the well-oriented microtubules

<br>⑤Finally we observed the contraction of well-oriented microtubules under cross-polarizing microscope.<br><br>

<p class="example111">Results</p> <p class="example6"> &nbsp; From the movie, we observed the contraction of well-oriented microtubules caused by the action of kinesin tetramers.</p>

<div class="example6">

<p><a class="image" title="team hokudai"><img alt="team hokudai" src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/50/1414277897IY0kj4I1TJeAMpJ1414277869.gif/800px-1414277897IY0kj4I1TJeAMpJ1414277869.gif" width="600" height="400" border="0" /></a> </div>

<p class="clearLeft example6">(Figure4:Contraction of well-oriented microtubule) <br>&nbsp; </p><br><br>


<p class="example1"><a2 id="SHIRAKAWA"name="SHIRAKAWA">Dissucussion</a2></p> <p class="example6"> &nbsp; Our latest experiment revealed that the contraction speed of the well-oriented microtubule were not so fast. So, our next target is to raise the speed of contraction to make it useful for practical applications, To achieve this we are planning to design multiple contraction unit composed of sequential microtubules and Multimeric kinesin arrangements.</p>

</body>

</html>

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