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전체모임 회의록

2015.07.01.Wed

• 동력원 + 윗 부분에 방향성을 제시할 수 있는 것 붙이기
  

1) 동력원에 대한 논문 'A Polymerization-Powered Motor' 

2) Au 표면에 DNA 붙이기(논문'Maximizing DNA Loading on a Range of Gold Nanoparticle Sizes') 

3) 방향성을 제시할 수 있는 것 생각

A Polymerization-Powered Motor

1.원리
-motor is powered by ROMP(ring opening metathesis polymerization) of norborene
-monomer 농도기울기가 있을때, motor는 chemotaxis현상을 보인다.[*chemotaxis(주화성):화학 물질의 농도차를 감수하여 이동하는 생리기능, 화학 주성이라고도 함]

2.gold-silica Janus particles 합성하기(0.96μm silica partricle 사용)

• 금입자에 SiO2 코팅

http://nanocomposix.com/collections/silica-coated-gold
1) 0.96μm silica partricles : These particles were deposited as thin films
2) gold was deposited onto the monolayers -> asymmetric Janus particles
3) particles were modified with the Grubb's catalyst on the silica side(*Grubb's catalyst :relatively high stability and high polymerization activity with norbornene)

3.motor 이동

• motor particle------(exposure to a monomer solution)------>polymer deposition on the motor surface
• Janus particle는 비대칭 -> 이것은 방향성을 증가시킴 (in directionality leading to the higher overall increase in diffusion)
• 농도차로 이동하는 원리
  

1) 비대칭적인 촉매 : particle의 한 쪽에서만 기질(substrate)을 소비함, 낮은 농도의 products와 더 느리게 확산하는 product를 모두 방출

2) 비대칭적인 촉매는 particle을 가로질러 osmotic force(삼투력)를 만듬 

3) 이 힘은 유체의 흐름을 발생시킴 : 낮은 기질 농도(the catalytic side)에서 더 높은 기질 농도(the noncatalytic side) 쪽으로

   => particle은 유체의 흐름과 반대방향으로 움직임

방향성 제시

• Structure and operation of an autonomous DNA nanomotor

1. E,F 두 가닥으로 구성된 모터
2. E strand에는 RNA-cleaving10-23 DNA enzyme가 있음
3. F strand는 두 가지의 fluorophores가 존재함
4. The enzyme substrate(S)는 DNA–RNA chimera임
5. E strand가 수축상태(close)에서 S가 결합함으로써 팽창상태(open)가 됨
6. S는 RNA-cleaving10-23 DNA enzyme으로 인해 절단됨
7. S는 절단되어 S1,S2로 나뉘어졌다가 E strand에서 떨어져 나감
8. 이러한 원리로 open/close 시스템이 순환
9. 이 때 F strand의 fluorophores가 반응함

• Structure and operation of a Single DNA Molecule Nanomotor

1. Motor는 17mer DNA nanomotor (T1G2G3T4T5G6G7T8G9T10G11G12T13T14G15G16T17)로 구성됨
2. 17mer DNA nanomotor는 tetraplex (TE) 형태로 바뀔 수 있음
3. 17mer DNA nanomotor의 양쪽 끝부분에는 형광제와 소광제가 있음
4. 17mer DNA와 상보적인 strand α가 주입될 시 17mer DNA가 팽창하여 duplex (DU)형태로 바뀜
5. strand α는 strand β가 주입되면 strand α와 결합하여 Motor에서 떨어져 나감, 다시 원래 형태(TE)로 바뀜
6. 이러한 시스템이 순환

2015.06.25.Thu

• 'A Precisely Controlled DNA Biped Walking Device'에 대해 토론
  -rail(track)을 바둑판식으로 배열
  
  -linker를 oligo Guanine(quadruplex)=>add cytosine(duplex)로 사용
  

2015.06.24.Wed

• 'A Precisely Controlled DNA Biped Walking Device'의 기본 아이디어 사용
• 'A Precisely Controlled DNA Biped Walking Device' 논문 읽어오기

2015.06.23.Tue

• motor에 관한 논문 한 편 씩 읽어오기 , 토론
• 구체화 : track 위에서 움직이는 motor
• 'A Free-Runnning DNA Motor Powered by a Nicking Enzyme'의 reference 논문 각자 한 편 씩 읽어오기

2015.06.22.Mon

• 숙박 장소 알아보기
• 아이디어 내기 (큰 주제 : motor)

2015.06.02.Fri

• 자유 주제로 아이디어회의
• 스폰서 컨택

2015.05.29.Fri

• 팀 소개글 마무리, sponsor 컨택(동원그룹)
• 다음주 월요일 : 나머지 스폰서 컨택

2015.05.22.Fri

• 개인 논문 발표 및 토론

2015.05.06.Wed

• 나노바이오 동아리 신청서 작성

2015.04.29.Wed

• 창의재단 연구프로그램 신청서류 제출

2015.04.24.Fri

• 창의재단 연구프로그램 신청서류 작성

2015.04.14.Tue

• 분자탐지에 대한 아이디어 1차 발표(jellyfish sensor)

2015.04.03.Fri

1. 팀별 아이디어 발표(2nd)
   -화요일팀:nano bishop
   -금요일팀:
   =>이번주 winner:화요일팀의 nano bishop
2. 등록기간(~4/30)-24일 or 27일에 등록 / 비용은 팀원8명+교수님까지 해서 1/9로 나누어 냄(등록비 $250)
3. 과학창의재단 연구비 지원 지원글 작성 : 화요일(4/7일) 전체모임에서 파트 나누어 요일별 모임 때 작성
4. 스폰서 컨택 : 팀소개글 완성하기, 스폰서 컨택시 '수상경력'언급하기
5. 팀이름정하기
6. 개인별 세부적인 역할 정하기
7. 다음 아이디어 발표 주제 : 분자탐지(의미가 있는 biological event 포함!!)
   -ex: 암세포, 병원균에 대해 탐지 기능을 가지고 있는 것
   -size 구체적으로 언급하기
8. 아이디어 발표 : 4/14일 => 중간점검, 1차발표 / 4/28일 => 최종발표

2015.03.25.Wed

1. 팀소개글 모으기
2. 스폰서 컨택 할 곳 의견 내기

2015.03.17.Tue

1. 팀별 아이디어 발표
   -화요일팀:Insulin box
   -금요일팀:nano umbrella
   =>이번주 winner:금요일팀의 nano umbrella
2. 아이디어 발표에서 보완할 점
   -수치 넣어서 구조체 나타내고 설명하기
   -여러 사람의 idea를 인용하고, 모으기
   -구조체 design시 구체적으로 생각하기
3. 다음 발표 주제(03/31Tue)
   -'움직이는것'
   -동력, 에너지(ATP, H2O2 peroxidase)필요
   -eg)바람개비, 콘서트 장/ 앞줄에서 뒷줄로 풍선 넘기는 모습, kinesin 등

2015.03.11.Wed

1. 소개글 작성
   팀별로 파트 나눠서 소개글 작성
   -화요일팀:팀 전체적인 소개, 팀의 단기적/장기적 목표, 세부적인 계획(월별 또는 주별)
   -금요일팀:Biomod소개, Biomod 참가 동기, 기대효과(홍보, 인재양성 등)
2. 개인별 소개 글 (5줄 정도) 작성, 사진1장과 함께 => 저한테 메일로 보내주세요(이번주까지 ~03/15)
3. 튜터링 지원
   2팀 각자 제출기간에 맞춰서 지원하기
4. 다음주 팀 모임(03/17) : 아이디어 발표 있습니다
5. 2주뒤 팀 모임(03/25) : 소개글 다 같이 보고 수정하고, 스폰서 지원할 곳 정하겠습니다. 각자 1~2곳 생각해오세요

2015.03.03.Tue

1. 3월 스케줄 정하기
   1.가주제 정해서 팀별로 발표
   -주제는 free, 개인별로 아이디어를 낸 후 팀별 회의를 거쳐서 발표 작품 선택
   -발표에 포함되어야 할 내용 : 형태, 기능, 작동 원리, 장점, 단점, 보강방법(*구글 '학술검색'에서 아이디어를 보강하거나 원리를 확인 할 수 있음)
   -image첨부하기 : 나중에 upload file 교체 할 수 있으니 먼저 올려놓고->다듬은 후 교체(제목을 같게 해서 업로드 하면 뒤에 올린 파일로 교체됨)
   2.팀별 발표
   -날짜 : 2015.03.17.Tue
   -투표를 통해 우승 팀 선정
   -발표 후 다음 주제 정하기(다음 발표 : 2015.03.31.Tue)
   3.스폰서 contact을 위해서 우리팀 소개 자료 만들기 => 다음주 전체 모임(03.15.Wed)에 회의
2. 팀별 서기 정하기
   1.서기는 회의가 끝난 후, 회의 내용을 정리하여 위키 page upload
   2.화요일 팀 서기 : 박수현, 금요일 팀 서기 : 송효인