基礎ゼミチーム/basic seminar team/experiment result: Difference between revisions

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<a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/experiment_result/test">テスト</a><br>
<a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/experiment_result/test">テスト</a><br>
<h2>実験結果</h2>
<h2 id="wiki-mode2">実験結果</h2>
<div class="text">
<div class="text">
*Tar = Target DNA
*Tar = Target DNA

Revision as of 22:22, 1 September 2012

<html lang="ja"> <head> <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=Shift_JIS"> <meta http-equiv="content-style-type" content="text/css"> <title>BIOMOD 2012 Tohoku basic seminar team Wiki</title>



<style type="text/css"> @charset "Shift_JIS";

/* CDP 001 css 06/12/1 */ /* Copyright (c) 2006 WebDesignTemplates[http://wdt.pekori.jp] All rights reserved. */

/* default */ body,div,dl,dt,dd,ul,ol,li,h1,h2,h3,h4,h5,h6,pre,form,fieldset,input,p,blockquote,th,td{margin:0;padding:0;} table{border-collapse:collapse;border-spacing:0;} fieldset,img{border:0;} address,caption,cite,code,dfn,em,strong,th,var{font-style:normal;font-weight:normal;} ol,ul {list-style:none;} caption,th {text-align:left;} h1,h2,h3,h4,h5,h6{font-size:100%;} q:before,q:after{content:'';} /* fonts(Yahoo UI) */ body { font: 13px arial,helvetica,clean,sans-serif; *font-size:small; *font:x-small; } table { font-size: inherit; font: 100%; } select,input,textarea { font: 99% arial,helvetica,clean,sans-serif; }

/* 全体設定 */ html {

} body { } body#INDEX { } div#PAGETOP { width: 100%; font-size: 100%; color: #454341; } hr { display: none; } a:link { color: #414191; } a:visited { color: #414161; } a:hover { color: #914141; } a:active { color: #914141; }

/* ヘッダー */ div#HEADER { margin-bottom: 20px; border-top: solid 4px #595956; border-bottom: double 3px #FFFFFF; background: #DCDCDA; } h1#wiki-mode1 { padding: 0.3em 1em 0.3em 21px; font-size: 167%; letter-spacing: 0.2em; color: #9A4414; } ul#PAN { position: absolute; top: 10px; right: 0px; text-align: right; }

  1. INDEX ul#PAN{

display: none; }

  1. PAN li{

display: inline; }

  1. PAN a{

text-decoration: none; }

  1. PAN a:after{

content: "->"; }

/* メニュー */ div#MENU { width: 210px; float: left; }

  1. MENU h2{

width: 150px; margin: 0 20px 1em 20px; padding: 0.2em 10px; border: none; font-size: 107%; letter-spacing: 0.2em; color: #BA7464; }

  1. MENU ul{

width: 170px; margin: 0 20px 1em 20px; border-bottom: double 3px #FBFBFA; }

  1. MENU li{

margin-bottom: 15px; padding-top: 0.1em; background: #FBFBFA; }

  1. MENU li.menu-on {

background: #ECECEA; }

  1. MENU li a{

display: block; width: 150px; padding: 0.4em 10px 0.4em 10px; border-bottom: dotted 2px #DCDCDA; font-weight: bold; text-decoration: none; }

  1. MENU li a:hover,#MENU li a:active{

border-bottom: solid 2px #BA8474; text-decoration: none; }

/* 記事部分 */ div#KIZI { margin: 0 20px 0 210px; padding: 0 0 0 20px; border-left: solid 10px #FBFBFA; } h2#wiki-mode2 { padding: 0.3em 0; border-bottom: solid 1px #CCCCCA; color: #BA7464; font-size: 122%; letter-spacing: 0.2em; } div.text { margin: 0.5em 2.5em 1.5em 0; line-height: 1.7; } .text p { margin-bottom: 1em; } h3 { padding: 0.6em 0 0.4em 0; letter-spacing: 0.1em; } h4 { padding: 0.5em 0 0.2em 0; letter-spacing: 0.1em; } h5,h6 { padding: 0.4em 0 0.2em 0; } .text ul.modori { text-align: right; font-size: 85%; list-style: none; } .modori a:link,.modori a:visited{ color: #BA7464; }

/* リスト */ .text ol { margin: 0 0 1em 35px; list-style: decimal; } .text ul { margin: 0 0 1em 35px; list-style: square; } dl { margin: 0 0 1em 5px; } dt { color: #9A5434; font-weight: bold; } dd { margin: 0 1em 1em 1.5em; }

/* フッター */ div#FOOTER { width: 100%; clear: left; text-align: right; margin-top: 20px; border-top: double 3px #FFFFFF; border-bottom: solid 6px #595956; background: #DCDCDA; }

  1. FOOTER h2 {

display: none; }

  1. FOOTER ul {

padding: 0.8em 2em; }

  1. FOOTER li {

display: inline; padding: 0 0.5em; font-size: 92%; }

  1. FOOTER a{

text-decoration: none; } address { display: inline; }

/* 強調・追加・削除 */ em { font-weight: bold; } strong{ font-weight: bold; color: #814121; } ins { text-decoration: underline; } del { text-decoration: line-through; }

/* フォーム */

input { margin-top: 0.5em; } input#TEXT { border: solid 1px #CCCCCA; } input#BUTTON { padding: 1px 0.5em; border: double 3px #CCCCCA; background: #EDEDEA; } textarea { margin-top: 0.5em; border: solid 1px #CCCCCA; } select { margin-top: 0.5em; border: solid 1px #CCCCCA; }

/* 引用 */ blockquote { padding-left: 0.8em; margin: 1em; border-left: 2px dashed #EAEAED; } cite,q { text-decoration: underline; }

/* 整形済みテキスト */ pre { padding: 0.3em; border: solid 1px #DADADC; font-size: 92%; font-family: monospace; }

  1. marker {

padding:3px; border-style:solid; border-width:0px 0px 0px 3px; border-color:#333; float:left; }

  1. photo{

}

/* 物理要素 */ b { font-weight: bold; } /* 太字 */ i { font-style: italic; } /* 斜体 */ big { font-size: 107%; } /* 文字大 */ small { font-size: 85%; } /* 文字小 */ tt { font-family: monospace; } /* 等幅 */ </style> </head> <body id="INDEX"> <div id="PAGETOP">


<!--================--> <!--　　ヘッダー　　--> <!--================--> <div id="HEADER"> <h1 id="wiki-mode1">BIOMOD基礎ゼミチーム Wiki</h1> <ul id="PAN"> 

 <li>index</li>

</ul> </div> <hr>


<!--================--> <!--　　メニュー　　--> <!--================--> <div id="MENU"> <h2>menu</h2> 

<ul>
  <li id="MENU01" class="menu-on"><a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team">TOP</a></li>
  <li id="MENU02"><a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/design">Design</a></li>
  <li id="MENU03"><a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/diary">Diary</a></li>
  <li id="MENU04"><a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/experiment_result">Experiment result</a></li>
  <li id="MENU05"><a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/member">Member</a></li>
  <li id="MENU06"><a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/link">Link</a></li>

</ul> </div> <hr>


<!--================--> <!--　　記事部分　　--> <!--================--> <div id="KIZI">

<a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/experiment_result/test">テスト</a><br> <h2 id="wiki-mode2">実験結果</h2> <div class="text">

  • Tar = Target DNA
  • S1,S2,S3 = Selector1,Selector2,Selector3


<!-- 8月9日 -->


<p><h3>2012/08/09</h3> <div> <img src="http://openwetware.org/images/a/ac/Loop_tornament01.jpg" name="pic1" id="photo"><br> </div> <div id="marker">1+4</div><div id="marker">1+3</div><div id="marker">1+2+3+4</div><div id="marker">1+2+3</div><div id="marker">1+2</div><div id="marker">4</div><div id="marker">3</div><div id="marker">2</div><div id="marker">1</div><div id="marker">マーカー</div><br> <div style="clear:left">10%アクリルアミド</div><br> <ul> <li>アクリルアミド10%と20%のゲルを用いて実験</li> <li>10%はmidori greenを用いて染色したがバンドを確認できず(写真なし)</li> <li>20 %はsyber goldで染色し上の写真が撮影できた</li> <li>1+3,1+4はハイブリが成功している様子</li> </ul> </p>

<!-- 8月17日 -->

<p> <h3>2012/08/17</h3> <img src="http://openwetware.org/images/8/8b/20120817.tornamentandloop.45min.sybergold.jpg" id="photo"><br> <div id="marker">1+4</div><div id="marker">1+3</div><div id="marker">1+2+3+4</div><div id="marker">1+2+3</div><div id="marker">1+2</div><div id="marker">4</div><div id="marker">3</div><div id="marker">2</div><div id="marker">1</div><div id="marker">マーカー</div><br> <div style="clear:left">10%アクリルアミド</div> <ul> 

 <li>今日の実験はDNAにMg2+の1.25%バッファー15μLを入れ忘れたためバンドが拡散しうまく出なかった</li>
 <li>DNAを放置する時間を50分に延長</li>
</ul>

</p>

<!-- 8月20日 -->

<p> <h3>2012/08/20</h3> <img src="http://openwetware.org/images/2/2a/Tornament-loop10%25.3h.50%2C100v.jpg" id="photo"><br>

<div id="marker">Marker</div><div id="marker">Tar+S3</div><div id="marker">Tar+S2</div><div id="marker">Tar+S1+S2+S3</div><div id="marker">Tar+S1+S2</div><div id="marker">Tar+S1</div><div id="marker">S3</div><div id="marker">S2</div><div id="marker">S1</div><div id="marker">Tar</div><br>

<div style="clear:left">10%アクリルアミド</div>


<img src="http://openwetware.org/images/5/56/Tornament-loop20%25.4h.50%2C100v.jpg" id="photo"><br>

<div id="marker">Tar+S1</div><div id="marker">Tar+S3</div><div id="marker">Tar+S2</div><div id="marker">S3</div><div id="marker">S2</div><div id="marker">Tar+S1+S2</div><div id="marker">Tar+S1+S2+S3</div><div id="marker">S1</div><div id="marker">Tar</div><br>

<div style="clear:left">20%アクリルアミド</div><br>

<br> <ul> <li>20%はバンドがゆがんでいたため結果が分からなかった。20%は結果が出にくく時間もかかるので今後は10％で行うことに</li> <li>結果の考察は10%について</li> <li>染色液はsyber goldを使用</li> <li>TargetがSelectorを移動するための時間を1時間に増加</li> <li>電気泳動を冷蔵庫の中(4℃)で行う</li> <li>電圧を50Vで行った</li> <li>結果として、1+2+3では1と3がハイブリしているものが確認できた。1+2+3+4では1と4がハイブリしているものが確認できた。</li> <li>2から3、3から4の移動が可能か</li> <li>Tar+S1+S2でTarとS1のバンドと、TarとS2のバンドが両方濃く出てしまっており、TarがS1からS2に移動したのか疑問が残る</li> <li>Tar+S1+S2+S3においてS1の周辺にバンドが出ておらず、入れ忘れてしまった可能性が高い</li> <li>S1からS2の移動が確認できなかったが、TarのS2からS3の移動は可能性が高い</li> </ul> </p>


<!-- 8月21日 -->

<hr> <p> <h3>2012/8/21</h3> <img src="http://openwetware.org/images/b/bf/Tornament-loop10%25.3h.not1234.jpg" id="photo"><br> <div id="marker">Marker</div><div id="marker">Tar+S3</div><div id="marker">Tar+S2</div><div id="marker">Tar+S1+S2</div><div id="marker">Tar+S1</div><div id="marker">S3</div><div id="marker">S2</div><div id="marker">S1</div><div id="marker">Tar</div><br> <div style="clear:left">10%アクリルアミド</div><br> <ul> <li>S2,S3の動作の確認</li> 

 <li>Tar+S1+S2+S3を抜いて20日と同様に実験</li>
 <li>結果として、Tar+S1+S2においてS1のバンドが消えているがS2のバンドがシングルストランドと同じところに出ておりTarがどちらにもくっついていないように見受けられる</li>

<li>S1,S2が自分同士でアグッているか、お互いにアグッている可能性あり</li> 

</ul>

</p> <hr>

<!-- 8月22日 -->

<p> <h3>2012/08/22</h3> <img src="http://openwetware.org/images/5/55/2012082210%253h-23-24-34.jpg" id="photo">

<ul> <li></li> <li></li> </ul> </p>

<!-- 8月24日 -->

<p> <h3>2012/08/24</h3> <img src="http://openwetware.org/images/7/72/To-nament_loop10%25_all.jpg" id="photo"> <ul> <li></li> <li></li> <ul> </ul> </p>

<ul class="modori"> 

 <li><a href="#PAGETOP">TOP</a></li>

</ul>

</div> <hr>

<hr>

<h2>履歴</h2> <div class="text"> 

<dl>
  <dt></dt>
  <dd></dd>
</dl>

<ul class="modori"> 

 <li><a href="#PAGETOP">TOP</a></li>

</ul> </div> <hr>

</div>


<!--================--> <!--　　フッター　　--> <!--================--> <div id="FOOTER"> <h2>連絡先</h2> <ul> 

<li id="FOOTER01"><a href="#PAGETOP">TOP</a></li>
<li id="FOOTER02"><address><a href="mailto:mail@address.com">mail</a></address></li>
<li id="FOOTER03"><address><a href="http://css.poromeria.com/">CSS Designplate</a></address></li>

</ul> </div>

</div> <a href=""></a>

</body> </html>

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